48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1588 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  631  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  64.72 
 
 
310 aa  427  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  30.49 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  31.37 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  28.03 
 
 
305 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  28.85 
 
 
303 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  28.94 
 
 
295 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  27.15 
 
 
318 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  27.78 
 
 
308 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  26.33 
 
 
307 aa  99.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  28.47 
 
 
314 aa  96.3  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  25.89 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  27.36 
 
 
332 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  28.67 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  27.04 
 
 
322 aa  92.8  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  24.07 
 
 
343 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  27.51 
 
 
303 aa  87  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  23.17 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  22.85 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  23.93 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  26.9 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  26.12 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  25.99 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  23.88 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  23.49 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  23.49 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  24.56 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  28.26 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  23.22 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  26.32 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  23.55 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  24.62 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  24.31 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  27.24 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  20.94 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  25.55 
 
 
327 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  24.92 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  24.01 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  24.79 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  25 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  24.89 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  25.5 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  24.6 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  27.57 
 
 
335 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  25.86 
 
 
324 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  24.12 
 
 
329 aa  49.3  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  24.38 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  29.57 
 
 
342 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>