51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1740 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  691    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  65.67 
 
 		 335 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  48.62 
 
 		 337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  42.39 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  34.8 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  33.72 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  29.94 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  29.55 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  28.44 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  27.3 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  28.81 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  30.83 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  28.94 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  26.7 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  26.46 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  27.32 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  25.07 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  26.37 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  25.96 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  24.84 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  24.86 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  27.81 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  24.56 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  23.68 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  26.16 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  27.5 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  24.86 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  25.39 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  25.28 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  25.23 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  28.76 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  23.96 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  28.06 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  24.18 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  25.96 
 
 		 292 aa  52.8  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  25.53 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  27.57 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  26 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  26 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  21.75 
 
 		 307 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  22.04 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  25.93 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  26.32 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  24.24 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  24.92 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  27.34 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  25.66 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  24.24 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  23.74 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  24.84 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  30.43 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>