65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5367 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  675    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  61.4 
 
 
323 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  58.23 
 
 
322 aa  401  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  46.2 
 
 
328 aa  309  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  44.27 
 
 
325 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  43.34 
 
 
336 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  42.5 
 
 
331 aa  245  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  39.76 
 
 
331 aa  231  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  35.74 
 
 
308 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  31.61 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  32.48 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  33.65 
 
 
314 aa  162  9e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  30.4 
 
 
305 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  27.91 
 
 
310 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  31.11 
 
 
307 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  32.32 
 
 
324 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  30.72 
 
 
303 aa  149  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  29.32 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  29.83 
 
 
339 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  28.92 
 
 
322 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  29.87 
 
 
332 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  29.55 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  27.19 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  27.19 
 
 
318 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  27.48 
 
 
345 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  28.3 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  29.19 
 
 
303 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  30.84 
 
 
324 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  25.83 
 
 
343 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  27.65 
 
 
336 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  27.67 
 
 
304 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  27.58 
 
 
306 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  28.66 
 
 
313 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  25.82 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  27.14 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  27.11 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  26.09 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  25.62 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  26.12 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  26.84 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  24.78 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  28.02 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  23.96 
 
 
333 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  24.23 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  25.51 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  23.1 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  25.36 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  24.69 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  24.22 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  24.39 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  25.24 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  24.6 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  23.18 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  24.19 
 
 
295 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  24.75 
 
 
286 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  25.1 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  24.29 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  26.43 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  24.63 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  23.18 
 
 
360 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  26.03 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  24.55 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  25.39 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  27.05 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>