55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2197 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  686    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  65.67 
 
 
335 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  49.85 
 
 
337 aa  343  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  43.58 
 
 
337 aa  295  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1194  hypothetical protein  34.31 
 
 
338 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.263515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6913  hypothetical protein  31.41 
 
 
341 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  28.66 
 
 
343 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6900  hypothetical protein  29.6 
 
 
345 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00019858  normal  0.575893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5224  hypothetical protein  29.41 
 
 
360 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  29.88 
 
 
343 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  26.89 
 
 
348 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  31.85 
 
 
342 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  29.51 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  27.62 
 
 
349 aa  93.6  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  26.68 
 
 
338 aa  89.4  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  28.13 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  27.51 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  27.73 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  26.04 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  25.14 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  25.75 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  25.21 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  25.95 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  29.29 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  25.52 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  25.37 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  24.5 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  25.57 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  23.32 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  26.14 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  26.88 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  25.69 
 
 
307 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  23.05 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  21.81 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  30.14 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  29.19 
 
 
295 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  23.78 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  25.23 
 
 
331 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  29.68 
 
 
295 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  26.36 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  27.72 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  25.4 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  24.55 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  25.54 
 
 
318 aa  50.4  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  23.39 
 
 
308 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  24.78 
 
 
310 aa  49.3  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  26.82 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  26.82 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  24.38 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  25.48 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  31.43 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  24.05 
 
 
303 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  31.18 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  25.47 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  23.55 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>