65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3477 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  638    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  51.3 
 
 
307 aa  322  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  49.83 
 
 
318 aa  317  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  50.17 
 
 
295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  48.99 
 
 
314 aa  298  6e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  48.5 
 
 
305 aa  294  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  47.16 
 
 
303 aa  278  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  45.67 
 
 
303 aa  262  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  43.23 
 
 
308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  40.71 
 
 
308 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  38.96 
 
 
310 aa  209  6e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  34.16 
 
 
324 aa  188  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  33.02 
 
 
322 aa  175  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  31.91 
 
 
322 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  32.06 
 
 
323 aa  168  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  31 
 
 
331 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  30.62 
 
 
343 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  29.17 
 
 
327 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  27.66 
 
 
345 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  29.91 
 
 
336 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  31.63 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  30.56 
 
 
331 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  29.72 
 
 
318 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  29.72 
 
 
318 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  30.12 
 
 
328 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  31.76 
 
 
332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  31.48 
 
 
324 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  27.64 
 
 
339 aa  142  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  28.01 
 
 
336 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  27.96 
 
 
303 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  28.21 
 
 
292 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  30.49 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  29.35 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  29.94 
 
 
348 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  29.08 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  27.38 
 
 
309 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  25.33 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  28.72 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  28.74 
 
 
304 aa  95.5  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  24.08 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  26.97 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  23.74 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  23.41 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  23.72 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  24.48 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  25.07 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  26.82 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  25.16 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  25.07 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0548  hypothetical protein  26.23 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1635  hypothetical protein  26.81 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042157  hitchhiker  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1033  hypothetical protein  23.49 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  26.96 
 
 
329 aa  62.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2197  hypothetical protein  25.57 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.0000000000995287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1797  hypothetical protein  23.51 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181242  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2605  hypothetical protein  30.94 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  22.65 
 
 
360 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  23.08 
 
 
350 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1740  hypothetical protein  24.86 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0980  hypothetical protein  22.22 
 
 
1588 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  20.97 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0241  hypothetical protein  26.67 
 
 
342 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  26.16 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3745  hypothetical protein  22.61 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000575812  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5231  hypothetical protein  21.82 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.180658  normal  0.555488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>