54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2041 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2041  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3624  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.149618  hitchhiker  0.000381597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3585  hypothetical protein  33.44 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3951  hypothetical protein  33.22 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04500  hypothetical protein  32.99 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13648  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1698  hypothetical protein  31.15 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2274  hypothetical protein  32.27 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.878327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3477  hypothetical protein  27.96 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2182  hypothetical protein  29.74 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2592  hypothetical protein  31.83 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.144309  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1742  hypothetical protein  26.89 
 
 		 345 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01030  hypothetical protein  31.29 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4539  hypothetical protein  28.62 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.608979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2199  hypothetical protein  25.8 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000313837  hitchhiker  0.000000000144433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3434  hypothetical protein  29.32 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3655  hypothetical protein  29.32 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0108  hypothetical protein  29.77 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1646  hypothetical protein  29.35 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0596  hypothetical protein  26.88 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0124798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5273  hypothetical protein  30.65 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000139147  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5367  hypothetical protein  29.19 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5753  hypothetical protein  30.35 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0483357  normal  0.930547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3972  hypothetical protein  27.27 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5751  hypothetical protein  25.08 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1645  hypothetical protein  28.94 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal  0.0144499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1531  hypothetical protein  25.32 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1587  conserved hypothetical protein, secreted  26.77 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6389  hypothetical protein  24.92 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2926  hypothetical protein  27.46 
 
 		 332 aa  99  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000128759  normal  0.265621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3583  hypothetical protein  27.97 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0422562  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3742  hypothetical protein  24.77 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1986  hypothetical protein  25.35 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383632  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1588  hypothetical protein  23.93 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3226  hypothetical protein  23.95 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.294763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0529  hypothetical protein  24.04 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313898  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0978  hypothetical protein  21.74 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3879  hypothetical protein  27.44 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2980  hypothetical protein  28.03 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000308677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0170  hypothetical protein  24.24 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1040  hypothetical protein  26.52 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  0.622762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2914  hypothetical protein  23.81 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0203142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4749  hypothetical protein  26.45 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0287  hypothetical protein  23.1 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1904  hypothetical protein  22.09 
 
 		 349 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.268081  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2462  hypothetical protein  23.99 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0923403 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00770  hypothetical protein  23.8 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.257903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3688  hypothetical protein  22.15 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2464  hypothetical protein  24.23 
 
 		 336 aa  45.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1559  hypothetical protein  29.9 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.327429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1677  hypothetical protein  31.17 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5862  hypothetical protein  24.12 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1671  hypothetical protein  22.04 
 
 		 360 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1690  hypothetical protein  24.16 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.11796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>