98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0072 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 505 aa  1017    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  31.35 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  30.52 
 
 		 523 aa  206  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  28.89 
 
 		 558 aa  201  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  30.5 
 
 		 523 aa  199  7e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  30.88 
 
 		 524 aa  196  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  36.9 
 
 		 555 aa  195  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  28.84 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  34.63 
 
 		 329 aa  137  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  33.48 
 
 		 309 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  31.91 
 
 		 721 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  31.06 
 
 		 719 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  30.4 
 
 		 487 aa  91.3  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  28.89 
 
 		 511 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  27.56 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  26.25 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.62 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  29.07 
 
 		 920 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  28.62 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  32.46 
 
 		 511 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  27.14 
 
 		 513 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  31.2 
 
 		 325 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  26.77 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  28.57 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  28.26 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  26.77 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  33.19 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  32.84 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  33.19 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  29.91 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.17 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  29.07 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  30.61 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  29.97 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  27.84 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  28.05 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  27.8 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  27.8 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  27.8 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  31.28 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  28.88 
 
 		 543 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  25.99 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  30.22 
 
 		 596 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  28.7 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  27.12 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  28.26 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  30.21 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  27.96 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  32.24 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  27.48 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  30.18 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  30.49 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  28.2 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  28.45 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  24.64 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  27.52 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  26.07 
 
 		 588 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  29.55 
 
 		 297 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  25.27 
 
 		 292 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  28.19 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  29.75 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  26.41 
 
 		 333 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  32.14 
 
 		 543 aa  54.3  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  26.69 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  30.56 
 
 		 285 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  28.95 
 
 		 495 aa  53.5  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  27.36 
 
 		 285 aa  53.5  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0571  CHAD domain-containing protein  32.82 
 
 		 324 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  30.09 
 
 		 292 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  25.48 
 
 		 322 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  26.43 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  27.48 
 
 		 297 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  28.15 
 
 		 512 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2560  hypothetical protein  27.87 
 
 		 296 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  28 
 
 		 291 aa  50.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  28.03 
 
 		 519 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  27.14 
 
 		 344 aa  50.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  29.15 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  28.88 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  25.1 
 
 		 338 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  26.79 
 
 		 309 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  28.44 
 
 		 292 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  25 
 
 		 313 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  28.21 
 
 		 494 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  27.14 
 
 		 522 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  22.66 
 
 		 292 aa  47.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  26.34 
 
 		 505 aa  47.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  45.61 
 
 		 508 aa  47.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  28.07 
 
 		 258 aa  47  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  27.35 
 
 		 253 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  37.31 
 
 		 265 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  28.04 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  28.04 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  26.89 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  26.2 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  26.24 
 
 		 598 aa  43.9  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  26.15 
 
 		 347 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>