98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1698 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  100 
 
 		 523 aa  1072    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  46.28 
 
 		 524 aa  432  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  45.68 
 
 		 555 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  44.11 
 
 		 522 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  42.58 
 
 		 523 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  42.21 
 
 		 558 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  39.03 
 
 		 517 aa  335  7.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  30.5 
 
 		 505 aa  193  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  32.08 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  32.83 
 
 		 309 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  29.04 
 
 		 721 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  32.42 
 
 		 487 aa  93.6  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  31.09 
 
 		 920 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  27.54 
 
 		 719 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  27.07 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  28.41 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  23.1 
 
 		 519 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.35 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  26.84 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  28.4 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  28.51 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  26.98 
 
 		 520 aa  67.8  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  26.34 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  25.79 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  24.28 
 
 		 543 aa  63.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  26.81 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  25.6 
 
 		 513 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  30.3 
 
 		 577 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  28.91 
 
 		 494 aa  60.1  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  27.62 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  27.62 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  27.62 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  24.41 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  26.79 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  27.54 
 
 		 545 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  28.45 
 
 		 588 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  27.68 
 
 		 495 aa  57  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  24.02 
 
 		 508 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  28.23 
 
 		 519 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  35.62 
 
 		 285 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  24.19 
 
 		 534 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  29.71 
 
 		 490 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  35.62 
 
 		 292 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  25.68 
 
 		 292 aa  55.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  27.65 
 
 		 325 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  27.76 
 
 		 330 aa  54.3  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  24.7 
 
 		 253 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  26.76 
 
 		 292 aa  53.9  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  28.72 
 
 		 688 aa  53.9  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  28.72 
 
 		 640 aa  53.9  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  26.76 
 
 		 527 aa  53.9  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  28.72 
 
 		 640 aa  53.9  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  28.72 
 
 		 640 aa  53.9  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  25.78 
 
 		 510 aa  53.5  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  28.37 
 
 		 308 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2103  CHAD domain containing protein  24.33 
 
 		 302 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  25.58 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  29.75 
 
 		 649 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  28.47 
 
 		 691 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  27.4 
 
 		 253 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  26.77 
 
 		 512 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  25 
 
 		 329 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  26.77 
 
 		 512 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  24.36 
 
 		 283 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  25.83 
 
 		 364 aa  50.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  28.51 
 
 		 285 aa  50.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  46.77 
 
 		 643 aa  50.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  24.91 
 
 		 539 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  37.5 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  25.1 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  29.41 
 
 		 286 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1188  CHAD domain containing protein  29.96 
 
 		 313 aa  49.3  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00821021  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  24.78 
 
 		 291 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  24.68 
 
 		 313 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  26.64 
 
 		 513 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  26.41 
 
 		 289 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  26.24 
 
 		 512 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  24.45 
 
 		 277 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  25.91 
 
 		 512 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  28.16 
 
 		 508 aa  47  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  24.46 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  22.26 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  22.26 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  26.58 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  22.26 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  27.27 
 
 		 258 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3911  CHAD domain-containing protein  26.8 
 
 		 289 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  29.55 
 
 		 327 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  23.74 
 
 		 510 aa  45.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  26.27 
 
 		 505 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  24.17 
 
 		 305 aa  44.3  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  26.72 
 
 		 292 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  40.68 
 
 		 545 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  40.32 
 
 		 543 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  24.61 
 
 		 310 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  24.23 
 
 		 540 aa  43.9  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  26.72 
 
 		 309 aa  43.5  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  26.62 
 
 		 539 aa  43.5  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>