215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1232 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 508 aa  1014    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  37.38 
 
 		 596 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  34.04 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  34.91 
 
 		 513 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  36.02 
 
 		 511 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  33.66 
 
 		 508 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  33.91 
 
 		 510 aa  233  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  31.68 
 
 		 519 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  36.93 
 
 		 511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  35.9 
 
 		 490 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  33.83 
 
 		 505 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  30.75 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  34.79 
 
 		 512 aa  199  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  34.41 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  33.71 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  31.7 
 
 		 543 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  33.79 
 
 		 540 aa  178  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  29.21 
 
 		 487 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  33.84 
 
 		 494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  31.46 
 
 		 494 aa  161  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  32.26 
 
 		 514 aa  160  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  33.81 
 
 		 510 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  30.74 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  32.95 
 
 		 318 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  33.69 
 
 		 508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  32.97 
 
 		 512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  29.29 
 
 		 505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  32.48 
 
 		 520 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  30.32 
 
 		 509 aa  120  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  27.89 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  33.33 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  25.63 
 
 		 505 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  31.88 
 
 		 327 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  32.94 
 
 		 310 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  32.8 
 
 		 329 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  27.15 
 
 		 505 aa  103  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  30.59 
 
 		 498 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  30.31 
 
 		 292 aa  100  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  31.79 
 
 		 321 aa  98.2  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  27.53 
 
 		 529 aa  96.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  26.42 
 
 		 510 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  26.8 
 
 		 521 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  25.12 
 
 		 502 aa  93.6  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  29.09 
 
 		 495 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  30.56 
 
 		 540 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  32.37 
 
 		 495 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  30.56 
 
 		 540 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  29.27 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  30.56 
 
 		 540 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  30.23 
 
 		 539 aa  90.9  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  28.39 
 
 		 518 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  26.82 
 
 		 518 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  30.77 
 
 		 511 aa  86.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  33.2 
 
 		 577 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  30.2 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  30.54 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  24.59 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  29.96 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  30.51 
 
 		 545 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  32.54 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  30.4 
 
 		 545 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  31.42 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  32.88 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  26.18 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  30.21 
 
 		 721 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  26.18 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  31.05 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  28.07 
 
 		 719 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  31.15 
 
 		 688 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  32.46 
 
 		 588 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  31.15 
 
 		 691 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  30.97 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  31.15 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  31.15 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  31.15 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  31.15 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  31.67 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  31.65 
 
 		 508 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  28.78 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  31.22 
 
 		 503 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  32.46 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  28.86 
 
 		 524 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  31.22 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  27.15 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  32.34 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  32.89 
 
 		 643 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  29.88 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  36.1 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  31.8 
 
 		 291 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  29.09 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  29.82 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  29.09 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  31.63 
 
 		 512 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  28.77 
 
 		 285 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  29.09 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  28.77 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1861  adenylate cyclase  26.85 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  30.32 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  30.59 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  26.4 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>