146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2933 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 520 aa  962    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  32.36 
 
 		 495 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  36.03 
 
 		 920 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  32.17 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  31.47 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  32.75 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  30.15 
 
 		 508 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  29.94 
 
 		 508 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  30.23 
 
 		 596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  31.32 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  31.32 
 
 		 512 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  28.24 
 
 		 521 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.88 
 
 		 511 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  30.59 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  30.32 
 
 		 512 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  37.05 
 
 		 522 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  27.45 
 
 		 487 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  30.9 
 
 		 519 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  31.32 
 
 		 505 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  34.01 
 
 		 719 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  29.61 
 
 		 510 aa  99.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  26.43 
 
 		 519 aa  98.6  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  36.55 
 
 		 721 aa  97.8  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  28.36 
 
 		 333 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  32.57 
 
 		 510 aa  97.4  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  28.63 
 
 		 322 aa  96.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  32.96 
 
 		 329 aa  95.9  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  35.25 
 
 		 358 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  28.12 
 
 		 344 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  29.09 
 
 		 508 aa  94.7  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  31.87 
 
 		 318 aa  93.6  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  29.82 
 
 		 494 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  27.81 
 
 		 523 aa  89.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  30.15 
 
 		 527 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  32.25 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  27.14 
 
 		 330 aa  87.8  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  27.69 
 
 		 494 aa  87.8  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  30.16 
 
 		 505 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  30.43 
 
 		 490 aa  87.8  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  30.71 
 
 		 524 aa  87.4  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  29.86 
 
 		 522 aa  87  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  28.93 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  28.78 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  25.41 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  34.36 
 
 		 688 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  34.36 
 
 		 691 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  35.74 
 
 		 577 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  34.36 
 
 		 649 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  31.03 
 
 		 539 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  34.36 
 
 		 640 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  34.36 
 
 		 640 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  34.36 
 
 		 640 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  22.76 
 
 		 523 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  27.48 
 
 		 514 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  28.73 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  27.88 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  29.8 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  31.79 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  25.07 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  34.71 
 
 		 643 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  27.05 
 
 		 558 aa  79  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  34.31 
 
 		 588 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  33.48 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  35.68 
 
 		 540 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  35.68 
 
 		 540 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  35.68 
 
 		 540 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  33.74 
 
 		 545 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  29.49 
 
 		 555 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  29.6 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  34.53 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  26.45 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  31.02 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  32.52 
 
 		 490 aa  73.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  32.93 
 
 		 545 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  32.23 
 
 		 543 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  30.03 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  32.18 
 
 		 272 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  27.43 
 
 		 544 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  29.75 
 
 		 505 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27.42 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  31.43 
 
 		 508 aa  67.8  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  27.48 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  31.64 
 
 		 310 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  23.86 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  28.51 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  28.51 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  27.35 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  35 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  26.05 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  30.09 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  28.34 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  28.19 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  27.77 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  30.53 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  30.9 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  30.74 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  22.4 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  34.55 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  25.36 
 
 		 505 aa  57  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  27.99 
 
 		 523 aa  57  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>