62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3177 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  720    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  31.88 
 
 		 285 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  31.8 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  28.16 
 
 		 505 aa  69.7  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  33 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1188  CHAD domain containing protein  31.7 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00821021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  29.17 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  28.85 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  29.25 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  28.63 
 
 		 521 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  27.42 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  28.1 
 
 		 721 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  26.48 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  27.23 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  28.88 
 
 		 522 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  27.56 
 
 		 309 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  27.9 
 
 		 358 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  25.62 
 
 		 636 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  26.79 
 
 		 555 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  27.17 
 
 		 534 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  29.41 
 
 		 539 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  24.44 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  25.83 
 
 		 523 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  25.89 
 
 		 558 aa  52.8  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  28 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  29.56 
 
 		 513 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  28.96 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  26.51 
 
 		 523 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  28.83 
 
 		 277 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  30.71 
 
 		 598 aa  49.7  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  27.27 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  28.87 
 
 		 512 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  26.83 
 
 		 517 aa  47.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  23.93 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  30.45 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  27.35 
 
 		 920 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  27.83 
 
 		 293 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  29.96 
 
 		 545 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  25.71 
 
 		 467 aa  46.2  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  30.22 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  29.86 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  27.44 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  25.82 
 
 		 333 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  27.85 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  28.19 
 
 		 527 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  27.19 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  25.09 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2560  hypothetical protein  28.1 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  27.47 
 
 		 511 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  27.41 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  38.64 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  28.16 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  28.52 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1575  CHAD domain containing protein  31.25 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  25 
 
 		 522 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  28.26 
 
 		 462 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  35.59 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  27.19 
 
 		 439 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  24.05 
 
 		 309 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  25.73 
 
 		 519 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  29.22 
 
 		 258 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  43.1 
 
 		 518 aa  42.7  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>