87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3986 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  554  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  57.41 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  57.25 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  49.09 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  41.11 
 
 		 308 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  40.48 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  37.55 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  29.36 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  30.08 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  33.64 
 
 		 490 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  30.05 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  32.43 
 
 		 510 aa  69.3  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  28.85 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  29.91 
 
 		 588 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  31.75 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  29.33 
 
 		 512 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  28.4 
 
 		 519 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  28.76 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  28.86 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  28.38 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  29.38 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  29.38 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  29.38 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  26.98 
 
 		 508 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  27.12 
 
 		 527 aa  58.9  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27.87 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  27.49 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  29.28 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  29.74 
 
 		 511 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  32.6 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  29.81 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  27.27 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  28.82 
 
 		 545 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  26.39 
 
 		 555 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  29.19 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  27.98 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  26.59 
 
 		 508 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  26.05 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  28.12 
 
 		 505 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  26.41 
 
 		 545 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  30.63 
 
 		 577 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  28.7 
 
 		 539 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  27.15 
 
 		 467 aa  53.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  28.97 
 
 		 534 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  25.35 
 
 		 439 aa  53.1  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  28.64 
 
 		 328 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  28.9 
 
 		 495 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  27.93 
 
 		 920 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  27.1 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  27.92 
 
 		 523 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  30.05 
 
 		 496 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  27.31 
 
 		 558 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  28.76 
 
 		 358 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  31.71 
 
 		 318 aa  49.3  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  27.89 
 
 		 721 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  26.09 
 
 		 524 aa  48.9  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  27.68 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  28.34 
 
 		 719 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  27.8 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  29.06 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  29.58 
 
 		 505 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  24.45 
 
 		 523 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  30.67 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3911  CHAD domain-containing protein  26.99 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  27.75 
 
 		 517 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  31.72 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  26.4 
 
 		 519 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  27.48 
 
 		 649 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  27.48 
 
 		 691 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  27.61 
 
 		 640 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  28.26 
 
 		 596 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  27.61 
 
 		 688 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  26.94 
 
 		 514 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  27.61 
 
 		 640 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  27.61 
 
 		 640 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  27.01 
 
 		 518 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  29.09 
 
 		 509 aa  45.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  29.41 
 
 		 510 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  25.82 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  24.27 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  35.21 
 
 		 510 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  26.47 
 
 		 519 aa  43.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  24.67 
 
 		 490 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  33.13 
 
 		 508 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  22.32 
 
 		 462 aa  42  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  24.79 
 
 		 598 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>