87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2705 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
492 aa  939    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  42.89 
 
 
510 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  43 
 
 
495 aa  294  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  43.58 
 
 
527 aa  292  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  37.74 
 
 
496 aa  245  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  41.95 
 
 
522 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  39 
 
 
505 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  38.11 
 
 
492 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  38.89 
 
 
512 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  37.34 
 
 
539 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  38.83 
 
 
519 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  36.65 
 
 
544 aa  221  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  37.3 
 
 
513 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5198  CHAD domain containing protein  37.17 
 
 
526 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  37.2 
 
 
502 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  37.2 
 
 
502 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  37.2 
 
 
502 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  35.48 
 
 
517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  36.65 
 
 
490 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  35.05 
 
 
509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  44.25 
 
 
598 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  33.4 
 
 
523 aa  130  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27.74 
 
 
504 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  33.91 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  32.74 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  29.06 
 
 
508 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  33.33 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  27.69 
 
 
510 aa  67  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  28.46 
 
 
920 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  30.05 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  30.43 
 
 
508 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  26.79 
 
 
508 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  28.06 
 
 
505 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  28.62 
 
 
543 aa  64.3  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  30.32 
 
 
310 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  30.94 
 
 
291 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  29.81 
 
 
277 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  34.96 
 
 
588 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  30.95 
 
 
545 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  27.57 
 
 
513 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  24.23 
 
 
331 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  32.74 
 
 
545 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  25.63 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  33.21 
 
 
272 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  29.59 
 
 
512 aa  62  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  30.43 
 
 
543 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  31.36 
 
 
540 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  31.36 
 
 
540 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  31.36 
 
 
540 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  29.07 
 
 
511 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  26.08 
 
 
596 aa  57  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  30.66 
 
 
304 aa  57  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  28.01 
 
 
512 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  25 
 
 
322 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3911  CHAD domain-containing protein  25.41 
 
 
289 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  26.27 
 
 
327 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  29.22 
 
 
512 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  29.28 
 
 
291 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  33.79 
 
 
490 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  30.64 
 
 
329 aa  54.3  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  21.86 
 
 
338 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  32.84 
 
 
510 aa  53.5  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  24.55 
 
 
514 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  28.44 
 
 
511 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  26.61 
 
 
293 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  25.6 
 
 
487 aa  50.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  24.38 
 
 
328 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  32.38 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  26.97 
 
 
721 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  24.35 
 
 
517 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  24.76 
 
 
555 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  28.69 
 
 
719 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  25.79 
 
 
519 aa  47.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  26.75 
 
 
505 aa  47  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  22.04 
 
 
330 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  26.87 
 
 
524 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  25.81 
 
 
313 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  26.62 
 
 
494 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  22.49 
 
 
344 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  26.39 
 
 
489 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  31.25 
 
 
285 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  26.39 
 
 
489 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  22.89 
 
 
347 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  26.19 
 
 
499 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  27.11 
 
 
522 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  26.14 
 
 
523 aa  43.5  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>