89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1978 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  100 
 
 
331 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  40.92 
 
 
333 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  40.37 
 
 
344 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  39.94 
 
 
338 aa  245  9e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  40.06 
 
 
347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  36.56 
 
 
330 aa  216  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  38.53 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  30 
 
 
318 aa  126  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  29.12 
 
 
920 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  27.84 
 
 
719 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  27.3 
 
 
519 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  26.1 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  26.3 
 
 
598 aa  70.1  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  27.64 
 
 
543 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  27.64 
 
 
545 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  41.98 
 
 
520 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  27.94 
 
 
588 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  26.86 
 
 
467 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  31.72 
 
 
721 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  27.05 
 
 
540 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  27.05 
 
 
540 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  27.34 
 
 
512 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  27.05 
 
 
540 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  25.36 
 
 
521 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  23.93 
 
 
505 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  23.68 
 
 
291 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  29.2 
 
 
492 aa  59.3  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  31.25 
 
 
508 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  30.28 
 
 
508 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  25.86 
 
 
495 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  31.16 
 
 
508 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  29.94 
 
 
510 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  23.41 
 
 
504 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  25.09 
 
 
297 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  25.9 
 
 
512 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  25.9 
 
 
512 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  24.2 
 
 
490 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  37.5 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  29.77 
 
 
513 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  34.13 
 
 
545 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.33 
 
 
511 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  27.47 
 
 
555 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  24.36 
 
 
487 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  26.35 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  27.54 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  27.34 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  32.56 
 
 
505 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  40 
 
 
510 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  23.66 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  43.75 
 
 
509 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  23.57 
 
 
490 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1575  CHAD domain containing protein  41.1 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  50.94 
 
 
494 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  28.89 
 
 
544 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  28.03 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  23.92 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  35.11 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  31.67 
 
 
514 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  21.82 
 
 
543 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  37.14 
 
 
636 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  38.96 
 
 
596 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  23.3 
 
 
511 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  22.78 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  23 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  39.29 
 
 
511 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  41.67 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  41.67 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  43.48 
 
 
498 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16960  hypothetical protein  29.82 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.365163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  41.38 
 
 
527 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  27.13 
 
 
510 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  28.37 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  22.77 
 
 
523 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  33.77 
 
 
283 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  41.38 
 
 
499 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  24.44 
 
 
524 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  36.21 
 
 
522 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  30.89 
 
 
494 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  35.63 
 
 
505 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  27.74 
 
 
286 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  23.36 
 
 
522 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  21.48 
 
 
328 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  30 
 
 
513 aa  43.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  35.56 
 
 
309 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  23.76 
 
 
523 aa  43.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  32.41 
 
 
509 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  25.76 
 
 
505 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  31.71 
 
 
292 aa  42.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  34.02 
 
 
325 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>