23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5198 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5198  CHAD domain containing protein  100 
 
 
526 aa  1013    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  35.84 
 
 
510 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  35.94 
 
 
519 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  37.13 
 
 
492 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  36.13 
 
 
527 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  37.23 
 
 
512 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  36.77 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  36.49 
 
 
495 aa  193  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  35.85 
 
 
490 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  38.54 
 
 
544 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  35.85 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  32.94 
 
 
496 aa  177  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  32.93 
 
 
539 aa  168  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  32.8 
 
 
513 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  31.97 
 
 
505 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  35.18 
 
 
502 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  35.18 
 
 
502 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  35.18 
 
 
502 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  32 
 
 
517 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  31.76 
 
 
509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  45.86 
 
 
598 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  29.41 
 
 
523 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  23.61 
 
 
920 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>