46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12255 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1025    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  64.86 
 
 
502 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  64.86 
 
 
502 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  64.86 
 
 
502 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  63.23 
 
 
517 aa  578  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  59.24 
 
 
509 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  38.66 
 
 
492 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  39.1 
 
 
495 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  38.78 
 
 
510 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  39.33 
 
 
505 aa  247  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  40.68 
 
 
512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  36 
 
 
539 aa  240  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  38.57 
 
 
496 aa  240  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  37.45 
 
 
522 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  36.78 
 
 
527 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  36.83 
 
 
519 aa  226  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  36.61 
 
 
490 aa  217  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  35.52 
 
 
544 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  36.86 
 
 
492 aa  203  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5198  CHAD domain containing protein  33.4 
 
 
526 aa  170  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  38.02 
 
 
598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  36.15 
 
 
272 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  28.21 
 
 
523 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  26.79 
 
 
508 aa  62.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  25 
 
 
521 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  26.61 
 
 
318 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  31.23 
 
 
545 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  28.21 
 
 
721 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  26.64 
 
 
523 aa  53.9  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  29.65 
 
 
358 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  30.16 
 
 
719 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  28.94 
 
 
543 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  25.93 
 
 
596 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16960  hypothetical protein  29.57 
 
 
326 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.365163  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  27.38 
 
 
329 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  30.22 
 
 
540 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  30.22 
 
 
540 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  30.22 
 
 
540 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  25.21 
 
 
333 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  24.44 
 
 
519 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  22.31 
 
 
330 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  26.82 
 
 
304 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  28.65 
 
 
558 aa  45.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  29.96 
 
 
588 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  24.63 
 
 
467 aa  43.5  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  28.72 
 
 
543 aa  43.5  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>