86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2718 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  100 
 
 
333 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  60.66 
 
 
344 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  61.56 
 
 
347 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  44.35 
 
 
338 aa  301  8.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  47.66 
 
 
322 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  44.62 
 
 
330 aa  289  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  40.92 
 
 
331 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  28.3 
 
 
318 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  30.65 
 
 
920 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  28.3 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  28.52 
 
 
598 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  28.03 
 
 
520 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  27.49 
 
 
510 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  26.69 
 
 
495 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  27.52 
 
 
524 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  27.21 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  27.92 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  27.95 
 
 
545 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  29.1 
 
 
588 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  28.92 
 
 
540 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  28.92 
 
 
540 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  28.92 
 
 
540 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  28.86 
 
 
545 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  27.95 
 
 
543 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  28.19 
 
 
508 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  24.21 
 
 
719 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  25.95 
 
 
521 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  23.67 
 
 
721 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  26.1 
 
 
522 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  24.72 
 
 
490 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  25.98 
 
 
508 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  22.88 
 
 
539 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  24.68 
 
 
492 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  24.46 
 
 
512 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  25.98 
 
 
508 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  27.21 
 
 
519 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  26.1 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  24.18 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  25.74 
 
 
519 aa  56.6  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  23.37 
 
 
505 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  24.49 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  29.38 
 
 
510 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  25.82 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  26.06 
 
 
505 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  23.16 
 
 
511 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  24.14 
 
 
512 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  24.23 
 
 
487 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  23.75 
 
 
512 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  23.08 
 
 
329 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  26.74 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  25 
 
 
527 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  22.56 
 
 
504 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  29.66 
 
 
544 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  21.74 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  25.28 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1575  CHAD domain containing protein  24.3 
 
 
308 aa  50.1  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  22.01 
 
 
513 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  23.21 
 
 
511 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  22.78 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  24.7 
 
 
492 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  23.42 
 
 
512 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  23.38 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  25.45 
 
 
313 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  25.88 
 
 
688 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  25.88 
 
 
691 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  25.88 
 
 
640 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  25.88 
 
 
640 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  25.88 
 
 
640 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  25.88 
 
 
649 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  23.29 
 
 
522 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  25.21 
 
 
513 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  25.82 
 
 
364 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  24.58 
 
 
509 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  22.39 
 
 
496 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  23.83 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  26.27 
 
 
643 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  25.39 
 
 
577 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  39.68 
 
 
283 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  34.78 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  29.17 
 
 
505 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  26.58 
 
 
310 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  25.49 
 
 
494 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  26.46 
 
 
517 aa  42.7  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  29.37 
 
 
502 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  29.37 
 
 
502 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  29.37 
 
 
502 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>