46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2569 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
297 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  56.27 
 
 
297 aa  318  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2560  hypothetical protein  48.65 
 
 
296 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  44.44 
 
 
305 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  34.59 
 
 
325 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  34.59 
 
 
309 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  29.41 
 
 
292 aa  85.5  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  26.82 
 
 
721 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  26.05 
 
 
719 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  27.21 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  26.16 
 
 
534 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  23.68 
 
 
521 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  23.79 
 
 
920 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  26.67 
 
 
487 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  29.54 
 
 
512 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1575  CHAD domain containing protein  26.79 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  25.1 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  29.11 
 
 
512 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  25.29 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  40.3 
 
 
636 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  25.51 
 
 
499 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  28.57 
 
 
512 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  24.21 
 
 
331 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  36.62 
 
 
681 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  24.12 
 
 
519 aa  53.1  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  27.54 
 
 
318 aa  52.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  27.05 
 
 
286 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  24.79 
 
 
344 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  25.23 
 
 
523 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  26.44 
 
 
358 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  25.68 
 
 
505 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  28.45 
 
 
514 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  26.34 
 
 
527 aa  49.3  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  25.33 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  28.57 
 
 
504 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  27.93 
 
 
511 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  24.89 
 
 
596 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  22.87 
 
 
512 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  24.76 
 
 
508 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  28.95 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  26.56 
 
 
494 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  24.9 
 
 
495 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  37.93 
 
 
347 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  23.63 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  25.81 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  23.38 
 
 
329 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>