102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3092 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  100 
 
 
496 aa  975    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  42.74 
 
 
490 aa  284  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  39.64 
 
 
510 aa  273  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  40.16 
 
 
492 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  40.62 
 
 
517 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  39.26 
 
 
495 aa  243  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  39.06 
 
 
509 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  36.84 
 
 
492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  38.32 
 
 
513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  39.5 
 
 
502 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  39.5 
 
 
502 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  39.5 
 
 
502 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  35.2 
 
 
539 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  36.95 
 
 
512 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  38.43 
 
 
519 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  35.01 
 
 
527 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  37.44 
 
 
544 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  33.47 
 
 
505 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  36.73 
 
 
522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5198  CHAD domain containing protein  32.94 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  42.21 
 
 
598 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  33.06 
 
 
523 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  34.16 
 
 
329 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  28.79 
 
 
596 aa  71.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  29.57 
 
 
505 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  28.13 
 
 
511 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  31.18 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  31.42 
 
 
540 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  31.42 
 
 
540 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  31.42 
 
 
540 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  33.33 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  26.7 
 
 
534 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  29.97 
 
 
505 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  27.9 
 
 
508 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  28.63 
 
 
490 aa  64.3  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  29.63 
 
 
513 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  27.08 
 
 
329 aa  63.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  31.53 
 
 
327 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  29.5 
 
 
543 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  27.27 
 
 
494 aa  63.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  28.4 
 
 
508 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  29.86 
 
 
512 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  30.22 
 
 
310 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  32.39 
 
 
511 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  28.46 
 
 
318 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  30.89 
 
 
588 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  30.92 
 
 
545 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  30.86 
 
 
545 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  29.57 
 
 
512 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  23.22 
 
 
518 aa  60.5  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  26.89 
 
 
512 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  27.13 
 
 
520 aa  57  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  28.51 
 
 
508 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  25.74 
 
 
304 aa  57  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  29.66 
 
 
328 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  26.9 
 
 
494 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  27.74 
 
 
524 aa  55.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  28.06 
 
 
505 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  26.56 
 
 
519 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  28.02 
 
 
291 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  30.64 
 
 
721 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  26.63 
 
 
499 aa  53.9  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  31.62 
 
 
691 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  31.62 
 
 
649 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  32.13 
 
 
285 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  31.62 
 
 
688 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  31.62 
 
 
640 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  31.62 
 
 
640 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  31.62 
 
 
640 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  29.78 
 
 
265 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  24.5 
 
 
521 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  28.57 
 
 
293 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  28.57 
 
 
318 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  30.05 
 
 
277 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  26.14 
 
 
519 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  46.15 
 
 
543 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  29.82 
 
 
643 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  24.7 
 
 
344 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  26.75 
 
 
487 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  22.98 
 
 
322 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  30.67 
 
 
577 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  25.1 
 
 
518 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  27.23 
 
 
286 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  25.33 
 
 
522 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  26.74 
 
 
920 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  22.82 
 
 
467 aa  48.5  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  27.59 
 
 
510 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  27.48 
 
 
462 aa  48.5  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  28.11 
 
 
291 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  26.13 
 
 
558 aa  47.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  24.61 
 
 
330 aa  47  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  24.46 
 
 
523 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  25.93 
 
 
555 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  22.39 
 
 
333 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  40 
 
 
681 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  30.57 
 
 
258 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  26.42 
 
 
344 aa  43.9  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  26.21 
 
 
308 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0458  adenylate cyclase  31.67 
 
 
211 aa  43.5  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  22.41 
 
 
309 aa  43.5  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>