101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0259 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  100 
 
 		 522 aa  1017    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  66.8 
 
 		 512 aa  627  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  48.18 
 
 		 519 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  44.66 
 
 		 495 aa  316  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  41.06 
 
 		 510 aa  296  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  39.61 
 
 		 492 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  39.7 
 
 		 505 aa  253  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  39.84 
 
 		 527 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  41.51 
 
 		 492 aa  243  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  38.4 
 
 		 513 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  37.64 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  36.18 
 
 		 539 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  37.41 
 
 		 544 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  36.49 
 
 		 517 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  37.45 
 
 		 502 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  37.45 
 
 		 502 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  37.45 
 
 		 502 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  36.53 
 
 		 496 aa  206  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  37.8 
 
 		 490 aa  199  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5198  CHAD domain containing protein  35.85 
 
 		 526 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  42.67 
 
 		 598 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  31 
 
 		 523 aa  110  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  38.46 
 
 		 272 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  36.84 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  28.15 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  29.86 
 
 		 329 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  31.25 
 
 		 534 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  31.15 
 
 		 508 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  26.56 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  31.71 
 
 		 721 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  32.53 
 
 		 719 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  29.23 
 
 		 508 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  28.63 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  26.94 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  26.94 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  28.46 
 
 		 596 aa  63.9  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  27.94 
 
 		 318 aa  63.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  26.14 
 
 		 523 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  30.67 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  29.01 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3911  CHAD domain-containing protein  26.98 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  26.1 
 
 		 333 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  29.82 
 
 		 521 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  28.88 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  26.96 
 
 		 920 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  23.17 
 
 		 519 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  33.85 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  27.73 
 
 		 505 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  30 
 
 		 543 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  26.25 
 
 		 499 aa  56.2  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  23.64 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  32.26 
 
 		 512 aa  55.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  25.83 
 
 		 330 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  32.82 
 
 		 540 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  32.82 
 
 		 540 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  34.4 
 
 		 588 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  32.82 
 
 		 540 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  20.17 
 
 		 522 aa  54.3  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  27.05 
 
 		 558 aa  53.9  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  25.95 
 
 		 555 aa  53.5  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  26.46 
 
 		 524 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  32.06 
 
 		 358 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8259  CHAD domain containing protein  33.15 
 
 		 318 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  25.7 
 
 		 309 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  30.59 
 
 		 504 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  26.11 
 
 		 505 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  25.1 
 
 		 523 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  27.56 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  30.94 
 
 		 545 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  25.2 
 
 		 487 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  31.27 
 
 		 543 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1575  CHAD domain containing protein  28 
 
 		 308 aa  47.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  28.69 
 
 		 511 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  26.76 
 
 		 512 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  34.22 
 
 		 649 aa  47  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  34.22 
 
 		 688 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  34.22 
 
 		 691 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  34.22 
 
 		 640 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  34.22 
 
 		 640 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  34.22 
 
 		 640 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  25.21 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  23.92 
 
 		 344 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16960  hypothetical protein  35.53 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.365163  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  31.53 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  30.94 
 
 		 545 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  28.71 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  24.06 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  38.16 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  23.08 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  27.97 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  27.73 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  27.73 
 
 		 297 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  26.52 
 
 		 512 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  32.59 
 
 		 577 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  32 
 
 		 636 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  29.78 
 
 		 291 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  28.51 
 
 		 293 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2423  CHAD domain-containing protein  28.05 
 
 		 307 aa  44.3  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0460885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  28.08 
 
 		 327 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  27.47 
 
 		 513 aa  43.9  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>