188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1728 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 494 aa  967    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  42.97 
 
 		 490 aa  309  6.999999999999999e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  40 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  39.39 
 
 		 511 aa  240  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  37.89 
 
 		 513 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  37.84 
 
 		 512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  38.03 
 
 		 512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  38.43 
 
 		 505 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  40.43 
 
 		 511 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  37.22 
 
 		 514 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  37.45 
 
 		 510 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  35.43 
 
 		 508 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  32.61 
 
 		 487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  33.84 
 
 		 508 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  35.42 
 
 		 508 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  33.96 
 
 		 510 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  30.6 
 
 		 519 aa  152  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  40.91 
 
 		 329 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  31.42 
 
 		 596 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  30.8 
 
 		 494 aa  144  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  32.77 
 
 		 520 aa  143  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  30.93 
 
 		 543 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  37.65 
 
 		 310 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  31.21 
 
 		 505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27.55 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  34.23 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  32.04 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  32.18 
 
 		 327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  34.07 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  27.01 
 
 		 499 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  32.09 
 
 		 540 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  32.96 
 
 		 512 aa  96.3  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  31.74 
 
 		 510 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  32.88 
 
 		 509 aa  93.6  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  28.82 
 
 		 505 aa  92.8  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  34.93 
 
 		 292 aa  93.2  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  26.41 
 
 		 521 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  31.25 
 
 		 539 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  26.6 
 
 		 505 aa  90.9  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  29.89 
 
 		 495 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  34.86 
 
 		 511 aa  86.7  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  29.91 
 
 		 313 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  24.68 
 
 		 519 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  33.33 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  35.77 
 
 		 512 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  37.55 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  35.16 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  27.27 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  33.21 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  33.21 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  33.21 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  33.47 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  33.62 
 
 		 543 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  34.06 
 
 		 545 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  27.91 
 
 		 498 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  29.82 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  33.78 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  33.13 
 
 		 495 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  29.46 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  30.9 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  28.08 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  30.16 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  33.7 
 
 		 211 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  27.86 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  32.48 
 
 		 721 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  29.86 
 
 		 523 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  28.17 
 
 		 529 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  31.52 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  30.9 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  31.06 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  30.9 
 
 		 321 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  30.3 
 
 		 503 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  33.19 
 
 		 545 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  30.91 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  30.3 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  27.72 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  27.27 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  28.99 
 
 		 322 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  30.53 
 
 		 291 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  31.54 
 
 		 598 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  26.91 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  26.91 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  30 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  31.95 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  27.37 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  32.69 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  29.77 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  53.97 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  33.59 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  53.97 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  32.02 
 
 		 539 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  29.49 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  24.83 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  24.77 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  31.62 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  26.73 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  24.77 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  24.77 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>