92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000059 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  635    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  31.67 
 
 		 524 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  34.29 
 
 		 523 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  32.83 
 
 		 523 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  33.48 
 
 		 505 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  35.62 
 
 		 555 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  30.22 
 
 		 558 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  31.85 
 
 		 522 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  29.82 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  26.86 
 
 		 517 aa  93.6  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  28.63 
 
 		 511 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  28.78 
 
 		 508 aa  75.9  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  25.28 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  27.97 
 
 		 513 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  27.57 
 
 		 920 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  25.29 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  25 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  25.52 
 
 		 490 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  27.73 
 
 		 721 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  28 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27.91 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  28.94 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  27.92 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.41 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  26.72 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  27.92 
 
 		 512 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  25.65 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  27.85 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  29.31 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  25.86 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  28.89 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  26.2 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  25.76 
 
 		 521 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  27.31 
 
 		 540 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  27.31 
 
 		 540 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  27.31 
 
 		 540 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  25.75 
 
 		 508 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  24.07 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  28.3 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  26.55 
 
 		 508 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  26.5 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  27.07 
 
 		 543 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  26.16 
 
 		 545 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  27.43 
 
 		 649 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  25.9 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  26.73 
 
 		 487 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  27.43 
 
 		 691 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  26.84 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  27.49 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  23.38 
 
 		 329 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  26.07 
 
 		 719 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  27.43 
 
 		 640 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  27.43 
 
 		 640 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  27.43 
 
 		 640 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  27.43 
 
 		 688 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  24.66 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  24.66 
 
 		 285 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  26.84 
 
 		 596 aa  52.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  25.7 
 
 		 522 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  27.43 
 
 		 577 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  26.2 
 
 		 545 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  27.08 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  25.6 
 
 		 588 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  25.21 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  26.01 
 
 		 439 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  22.5 
 
 		 283 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  25.12 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  27.98 
 
 		 510 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  26.01 
 
 		 643 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  25 
 
 		 519 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  25.48 
 
 		 494 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  28.02 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  24.64 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  27.06 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  22.22 
 
 		 495 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  23.79 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  23.58 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  28.44 
 
 		 505 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  22.36 
 
 		 543 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  24.67 
 
 		 505 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  47.06 
 
 		 636 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  25.68 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  22.41 
 
 		 496 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  24.9 
 
 		 347 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  24.05 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  24.05 
 
 		 364 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  45.1 
 
 		 681 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  23.81 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  21.38 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  27.35 
 
 		 519 aa  42.4  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  23.89 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  25.12 
 
 		 253 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>