82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6748 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  100 
 
 		 325 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  70.72 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  39.04 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  38.97 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  40.23 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  40.08 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  41.45 
 
 		 277 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  30.77 
 
 		 487 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  29.17 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  33 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  31 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  33.91 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  30.37 
 
 		 558 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  29.41 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  29.41 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  29.41 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  30.27 
 
 		 511 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  33.19 
 
 		 490 aa  62.8  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  28.63 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  29.02 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  29.72 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  29.72 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  27.53 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  31.08 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  32.38 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  29.26 
 
 		 545 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  31.27 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  25.74 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  26.25 
 
 		 523 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  28.7 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  28.03 
 
 		 494 aa  55.8  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  29.76 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  27.04 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  23.29 
 
 		 534 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  28.05 
 
 		 519 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  30.32 
 
 		 504 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  28.31 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  27.65 
 
 		 523 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  28.57 
 
 		 543 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  29.07 
 
 		 721 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  30.65 
 
 		 510 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  30.89 
 
 		 508 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  28.64 
 
 		 510 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  28.17 
 
 		 512 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  27.01 
 
 		 495 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  28.28 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  28.52 
 
 		 545 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  25.1 
 
 		 920 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  27.97 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  27.52 
 
 		 524 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  25.42 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  23.7 
 
 		 462 aa  50.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  26.32 
 
 		 555 aa  49.7  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  27.17 
 
 		 467 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  28.29 
 
 		 719 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  27.43 
 
 		 522 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  29.48 
 
 		 508 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  27.52 
 
 		 596 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  26.69 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  29.09 
 
 		 527 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  30.31 
 
 		 577 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  28.02 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  28.81 
 
 		 510 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  28.46 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  28.05 
 
 		 509 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  24.69 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  38.1 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  30.05 
 
 		 518 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  26.95 
 
 		 499 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  24.91 
 
 		 519 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  23.81 
 
 		 544 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  26.19 
 
 		 505 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  27.24 
 
 		 598 aa  43.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  28.81 
 
 		 649 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  37.8 
 
 		 292 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  28.81 
 
 		 691 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  28.39 
 
 		 640 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  28.39 
 
 		 640 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  28.39 
 
 		 640 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  43.18 
 
 		 636 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  26.24 
 
 		 514 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  28.39 
 
 		 688 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>