47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0591 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  100 
 
 
292 aa  579  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  30.94 
 
 
297 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  32.84 
 
 
305 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  28.72 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  33.07 
 
 
309 aa  87  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  31.02 
 
 
534 aa  86.3  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2560  hypothetical protein  31.23 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  32.14 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  27.51 
 
 
920 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  34.23 
 
 
358 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  29.96 
 
 
721 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  31.8 
 
 
521 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  28.51 
 
 
513 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  30.53 
 
 
487 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  27.6 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  41.67 
 
 
636 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  30.64 
 
 
527 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  28 
 
 
364 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  31.74 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  26.89 
 
 
524 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  27.69 
 
 
596 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  26.07 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1575  CHAD domain containing protein  31.43 
 
 
308 aa  49.7  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  28.57 
 
 
512 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  29.51 
 
 
511 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  26.13 
 
 
514 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  27.97 
 
 
540 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  27.97 
 
 
540 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  27.97 
 
 
540 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  30.37 
 
 
719 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  27.8 
 
 
512 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  26.72 
 
 
523 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  26.13 
 
 
512 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  26.1 
 
 
328 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  27.8 
 
 
512 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  24.32 
 
 
309 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  27.11 
 
 
511 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  28.08 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  28.5 
 
 
495 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  26.64 
 
 
519 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  28.97 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  27.65 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  27.54 
 
 
545 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  43.33 
 
 
543 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  25.96 
 
 
545 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  28.37 
 
 
505 aa  42.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  31.71 
 
 
331 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>