48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1045 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  100 
 
 
309 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  86.41 
 
 
325 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  39.04 
 
 
297 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  39.37 
 
 
305 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2560  hypothetical protein  34.83 
 
 
296 aa  155  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  34.81 
 
 
297 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  33.2 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  32.16 
 
 
534 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  31.05 
 
 
721 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.97 
 
 
521 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  32.88 
 
 
920 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  30 
 
 
719 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  28.4 
 
 
364 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  29.96 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  29.39 
 
 
487 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  32.63 
 
 
285 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  31.92 
 
 
509 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  30.22 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  27.07 
 
 
524 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  26.59 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  27.94 
 
 
358 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  30.67 
 
 
508 aa  52.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  44 
 
 
636 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  29.28 
 
 
511 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  28.29 
 
 
514 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  28.46 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  29.5 
 
 
505 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  26.27 
 
 
327 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  27.31 
 
 
512 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  31.44 
 
 
527 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  39.19 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  24.14 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  28.63 
 
 
512 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  28.04 
 
 
504 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  25.71 
 
 
505 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  29.72 
 
 
490 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  47.46 
 
 
285 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  47.46 
 
 
292 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  27.49 
 
 
512 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  36.11 
 
 
681 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  28.38 
 
 
511 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  25.79 
 
 
522 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  37.37 
 
 
520 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  25.69 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  25.34 
 
 
523 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  28.79 
 
 
304 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  26.72 
 
 
523 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  35.56 
 
 
331 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>