88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0409 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  98.6 
 
 		 285 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  57.91 
 
 		 283 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  30.3 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  32.9 
 
 		 487 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  31.8 
 
 		 513 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  28.98 
 
 		 508 aa  75.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  36.24 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  36.23 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  30.24 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  32.35 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27.85 
 
 		 504 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  28.69 
 
 		 519 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  29.58 
 
 		 512 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  30.25 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  31.78 
 
 		 508 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  30.71 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  32.53 
 
 		 721 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  30.4 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  31.78 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  27.67 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  25.1 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  29.58 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  29.71 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  29.8 
 
 		 596 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  29.58 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  24.51 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  26.41 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  32.56 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  30.58 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  28.63 
 
 		 540 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  28.63 
 
 		 540 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  27.94 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  28.63 
 
 		 540 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  29.36 
 
 		 555 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  28.1 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  27.83 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  32.71 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  31.02 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  26.55 
 
 		 920 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  29.81 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  25.94 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  26.02 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  28.63 
 
 		 521 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  22.44 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  27.4 
 
 		 519 aa  56.2  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  29.57 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  29.31 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  30.56 
 
 		 510 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  28.93 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  30.73 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  31.22 
 
 		 277 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  23.55 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  32.23 
 
 		 510 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  28.9 
 
 		 505 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  24.21 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  30.4 
 
 		 719 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  27.53 
 
 		 545 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  27.98 
 
 		 534 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  30.6 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  30.57 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  25.89 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  28.19 
 
 		 509 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  28.03 
 
 		 514 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  29.26 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  26.34 
 
 		 545 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  28.24 
 
 		 588 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  24.47 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  30.58 
 
 		 527 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  30.52 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  27.09 
 
 		 499 aa  49.3  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  24.65 
 
 		 517 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  31.73 
 
 		 520 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  28.21 
 
 		 496 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  35.27 
 
 		 520 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  36.36 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 498 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  31.17 
 
 		 495 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  26.64 
 
 		 297 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  29.27 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  23.91 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  31.4 
 
 		 543 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  29.52 
 
 		 518 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  46.3 
 
 		 636 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  28.45 
 
 		 517 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  44.07 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2781  CHAD domain-containing protein  29.18 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  29.75 
 
 		 522 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>