89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1301 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  100 
 
 
522 aa  1066    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  45.28 
 
 
558 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  44.11 
 
 
523 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  39.84 
 
 
555 aa  364  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  40.42 
 
 
524 aa  342  9e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  38.02 
 
 
523 aa  340  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  32.99 
 
 
517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  31.35 
 
 
505 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  31.58 
 
 
329 aa  137  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  31.85 
 
 
309 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  26.02 
 
 
920 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  28.1 
 
 
467 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  28.32 
 
 
487 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  26.05 
 
 
721 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  27.31 
 
 
719 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  28.78 
 
 
511 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  25.32 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.7 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  23.02 
 
 
519 aa  67  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  26.28 
 
 
510 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  29.86 
 
 
520 aa  64.7  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  27.34 
 
 
543 aa  62  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  26.47 
 
 
513 aa  62  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  27.9 
 
 
543 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  26.79 
 
 
545 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  28.52 
 
 
286 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  29.96 
 
 
512 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  29.96 
 
 
512 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  26.33 
 
 
519 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  25.82 
 
 
521 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  25.89 
 
 
540 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  25.89 
 
 
540 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  25.89 
 
 
540 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  27.4 
 
 
292 aa  58.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  23.48 
 
 
508 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  29.86 
 
 
258 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  26.34 
 
 
512 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  24.91 
 
 
508 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  28.37 
 
 
292 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  25.3 
 
 
289 aa  55.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  25.29 
 
 
509 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  26.45 
 
 
545 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  27.88 
 
 
285 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  27.86 
 
 
285 aa  54.3  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  25.94 
 
 
253 aa  53.5  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  24.77 
 
 
292 aa  53.5  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  25.81 
 
 
508 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  22.22 
 
 
522 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  26.67 
 
 
511 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  25 
 
 
534 aa  52  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  28.38 
 
 
527 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  25.45 
 
 
504 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  25.53 
 
 
304 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  26.97 
 
 
596 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  27.84 
 
 
494 aa  51.6  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  24.31 
 
 
329 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  27.92 
 
 
577 aa  51.2  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  26.19 
 
 
588 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  26.04 
 
 
539 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  26.94 
 
 
510 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2103  CHAD domain containing protein  25 
 
 
302 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.38393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  25.33 
 
 
496 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  27.43 
 
 
325 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  23.77 
 
 
328 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  26.58 
 
 
308 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  28.32 
 
 
305 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  28.24 
 
 
297 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  27.97 
 
 
490 aa  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  23.51 
 
 
322 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  47.92 
 
 
688 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  47.92 
 
 
640 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  24.09 
 
 
327 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  47.92 
 
 
640 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  47.92 
 
 
640 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  47.92 
 
 
691 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  47.92 
 
 
649 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  47.92 
 
 
643 aa  47  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  27.06 
 
 
344 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  26.29 
 
 
490 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  24.7 
 
 
510 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  25.19 
 
 
291 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  25.46 
 
 
462 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  25.79 
 
 
309 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  23.29 
 
 
333 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  35.14 
 
 
283 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  23.26 
 
 
330 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  24.36 
 
 
265 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  24.58 
 
 
358 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  25.72 
 
 
505 aa  43.9  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>