108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1006 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  100 
 
 
524 aa  1071    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  46.28 
 
 
523 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  41.45 
 
 
555 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  40.12 
 
 
523 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  41.36 
 
 
558 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  40.42 
 
 
522 aa  342  9e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  34.31 
 
 
517 aa  272  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  30.88 
 
 
505 aa  189  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  35.46 
 
 
329 aa  150  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  31.67 
 
 
309 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  29.37 
 
 
920 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  32.19 
 
 
318 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  31.33 
 
 
487 aa  84.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  29.92 
 
 
721 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  25.45 
 
 
519 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  26.47 
 
 
467 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  28.86 
 
 
508 aa  75.1  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  32.14 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.04 
 
 
445 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  29.29 
 
 
719 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  28.38 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  31.3 
 
 
513 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  28 
 
 
521 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  27.52 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  32.05 
 
 
286 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  28.74 
 
 
534 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  28.47 
 
 
505 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  29.92 
 
 
511 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  25.62 
 
 
504 aa  64.3  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  29.44 
 
 
545 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  28.33 
 
 
322 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  30.71 
 
 
520 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  27.42 
 
 
364 aa  61.6  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  26.8 
 
 
330 aa  61.2  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  29.3 
 
 
495 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  29.57 
 
 
490 aa  60.1  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  30.47 
 
 
540 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  30.47 
 
 
540 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  30.47 
 
 
540 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  31.62 
 
 
494 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  32.2 
 
 
512 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  32.2 
 
 
512 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  29.69 
 
 
344 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  29.03 
 
 
308 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  24.76 
 
 
508 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  32.41 
 
 
512 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  25.62 
 
 
508 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  26.97 
 
 
292 aa  57.4  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  30.23 
 
 
253 aa  57.4  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  30.61 
 
 
544 aa  57  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  29.61 
 
 
543 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  29.18 
 
 
545 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  26.32 
 
 
347 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  25.26 
 
 
344 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  27.37 
 
 
543 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  27.74 
 
 
496 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  25.96 
 
 
292 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  29.29 
 
 
588 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  28.04 
 
 
304 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.19 
 
 
511 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  30.9 
 
 
577 aa  54.7  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  25.96 
 
 
285 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  28.02 
 
 
292 aa  54.3  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  27.07 
 
 
309 aa  54.7  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  25.36 
 
 
510 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  28.7 
 
 
258 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  27.31 
 
 
325 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  27.24 
 
 
490 aa  53.9  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  25.75 
 
 
338 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  26.46 
 
 
522 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  29.73 
 
 
327 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  26.86 
 
 
265 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  24.41 
 
 
305 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  24.89 
 
 
291 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  27.94 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  25.22 
 
 
596 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  28.5 
 
 
328 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  30.33 
 
 
539 aa  51.2  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  27.52 
 
 
325 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  26.11 
 
 
253 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  27.23 
 
 
519 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  26.89 
 
 
292 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  24.79 
 
 
297 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  26.07 
 
 
510 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  29.46 
 
 
691 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1575  CHAD domain containing protein  30.41 
 
 
308 aa  48.5  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  29.46 
 
 
649 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  29.46 
 
 
688 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  23.81 
 
 
329 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  29.46 
 
 
640 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  29.46 
 
 
640 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  29.46 
 
 
640 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2056  CHAD  30.67 
 
 
253 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000461934  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  27.49 
 
 
313 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  30.59 
 
 
283 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26940  hypothetical protein  28.89 
 
 
256 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  28.27 
 
 
643 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  34.31 
 
 
510 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  30.77 
 
 
489 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  30.77 
 
 
489 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>