42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_13200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2251  hypothetical protein  44.44 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2056  CHAD  43.21 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000461934  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  41.06 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4025  CHAD  42.29 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2447  CHAD domain-containing protein  41.15 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3462  CHAD domain-containing protein  45.29 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2307  CHAD domain containing protein  45.29 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26940  hypothetical protein  40.24 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2282  hypothetical protein  40.39 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1909  CHAD domain-containing protein  43.95 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  hitchhiker  0.00000249861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1749  CHAD domain-containing protein  45.63 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000731598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22940  CHAD domain-containing protein  41.53 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.660754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  35.71 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  26.89 
 
 		 523 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  29.86 
 
 		 522 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  24.8 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  34.62 
 
 		 329 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  28.7 
 
 		 524 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  25.68 
 
 		 467 aa  53.1  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  26.73 
 
 		 558 aa  48.9  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  26.48 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  31.03 
 
 		 527 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  28.14 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  27.06 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  27.27 
 
 		 523 aa  45.8  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  30.48 
 
 		 545 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  27.35 
 
 		 328 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  28.08 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  24.39 
 
 		 347 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  30.57 
 
 		 496 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1188  CHAD domain containing protein  29.19 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00821021  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  26.94 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  41.67 
 
 		 596 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  28.69 
 
 		 540 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  28.69 
 
 		 540 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  29.17 
 
 		 364 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  28.69 
 
 		 540 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  28.37 
 
 		 555 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  26.61 
 
 		 521 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  29.63 
 
 		 511 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  30.84 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>