23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_22940 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_22940  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 251 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.660754  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  56 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2447  CHAD domain-containing protein  53.41 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2056  CHAD  47.37 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000461934  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4025  CHAD  52.87 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2251  hypothetical protein  46.96 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2307  CHAD domain containing protein  51.19 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1909  CHAD domain-containing protein  51.17 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  hitchhiker  0.00000249861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3462  CHAD domain-containing protein  51.56 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1749  CHAD domain-containing protein  50.87 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000731598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26940  hypothetical protein  47.81 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2282  hypothetical protein  49.19 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  41.53 
 
 		 258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  29.25 
 
 		 555 aa  52  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  30.66 
 
 		 511 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  33.64 
 
 		 513 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  26.51 
 
 		 517 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  32.85 
 
 		 505 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  31.58 
 
 		 519 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.77 
 
 		 511 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  27.91 
 
 		 523 aa  45.8  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  29.77 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  34.76 
 
 		 512 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>