21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1909 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1909  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  hitchhiker  0.00000249861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2307  CHAD domain containing protein  92.16 
 
 		 259 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3462  CHAD domain-containing protein  92.16 
 
 		 259 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1749  CHAD domain-containing protein  83.4 
 
 		 259 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000731598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2251  hypothetical protein  53.78 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4025  CHAD  58.87 
 
 		 255 aa  248  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2056  CHAD  52.99 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000461934  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  45.38 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2447  CHAD domain-containing protein  50.81 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22940  CHAD domain-containing protein  50.78 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.660754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  43.95 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26940  hypothetical protein  44.09 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2282  hypothetical protein  44.88 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  28.17 
 
 		 524 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  28.3 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  31.6 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  28.45 
 
 		 539 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  40.98 
 
 		 517 aa  42.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  41.27 
 
 		 505 aa  42.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  26.67 
 
 		 508 aa  42.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  26.67 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>