19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4025 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4025  CHAD  100 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2251  hypothetical protein  60.08 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2056  CHAD  58.1 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000461934  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2307  CHAD domain containing protein  61.29 
 
 		 259 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3462  CHAD domain-containing protein  60.89 
 
 		 259 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1909  CHAD domain-containing protein  58.87 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  hitchhiker  0.00000249861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1749  CHAD domain-containing protein  58 
 
 		 259 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000731598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  50 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2447  CHAD domain-containing protein  53.88 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22940  CHAD domain-containing protein  52.65 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.660754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26940  hypothetical protein  47.79 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2282  hypothetical protein  47.79 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  42.29 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  27.23 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  27.98 
 
 		 524 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  34.34 
 
 		 534 aa  45.4  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.68 
 
 		 521 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1188  CHAD domain containing protein  27.69 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00821021  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  30.09 
 
 		 318 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>