36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1214 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  28.69 
 
 
467 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  30.64 
 
 
920 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  26.83 
 
 
504 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  28.09 
 
 
523 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  27.27 
 
 
487 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  24.1 
 
 
513 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  28.3 
 
 
309 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  25.74 
 
 
517 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  27.98 
 
 
558 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  25.68 
 
 
512 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  25.7 
 
 
511 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  28.02 
 
 
524 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  26.76 
 
 
523 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  24.77 
 
 
522 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  25.27 
 
 
555 aa  52.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  26.5 
 
 
512 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  25.89 
 
 
509 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  26.61 
 
 
511 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  26.19 
 
 
329 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  23.88 
 
 
512 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  24.64 
 
 
445 aa  49.3  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  21.11 
 
 
527 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  22.26 
 
 
519 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  26.27 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  25.69 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2447  CHAD domain-containing protein  34.85 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0419057  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  24.32 
 
 
505 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  22.58 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  27.18 
 
 
508 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  35.59 
 
 
364 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  24.88 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  40.74 
 
 
462 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  27.18 
 
 
289 aa  42.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  27.52 
 
 
519 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  22.32 
 
 
308 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>