104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0051 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  100 
 
 
527 aa  1011    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  44.12 
 
 
510 aa  356  5.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  42.77 
 
 
495 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  42.75 
 
 
492 aa  286  7e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  41.02 
 
 
512 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  39.6 
 
 
492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  39.84 
 
 
519 aa  270  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  40.19 
 
 
522 aa  262  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  41.22 
 
 
544 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  36.62 
 
 
509 aa  238  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  37.55 
 
 
502 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  37.55 
 
 
502 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  37.55 
 
 
502 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  36.74 
 
 
517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  36.72 
 
 
513 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  36.68 
 
 
539 aa  231  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  36.38 
 
 
505 aa  223  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  35.16 
 
 
496 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5198  CHAD domain containing protein  36.45 
 
 
526 aa  212  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  32.7 
 
 
490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  39.35 
 
 
598 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  31.68 
 
 
523 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  28.18 
 
 
596 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  29.93 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  27.46 
 
 
508 aa  77.4  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  27.74 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  29.94 
 
 
520 aa  73.6  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  31.62 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  27.81 
 
 
494 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  28.68 
 
 
511 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  27.27 
 
 
327 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  27.72 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  30.67 
 
 
721 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  27.44 
 
 
920 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  31.33 
 
 
297 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  27.68 
 
 
511 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  28.71 
 
 
277 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  29.89 
 
 
505 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  29.22 
 
 
490 aa  61.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  28.57 
 
 
512 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  28.18 
 
 
329 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  28.1 
 
 
328 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  27.71 
 
 
329 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  25.77 
 
 
504 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3911  CHAD domain-containing protein  28.41 
 
 
289 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  25.67 
 
 
519 aa  58.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  31.58 
 
 
719 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  29.17 
 
 
543 aa  57.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  28.12 
 
 
558 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  27.31 
 
 
523 aa  58.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  27.04 
 
 
310 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  25 
 
 
333 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  28.4 
 
 
289 aa  57.4  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  24.38 
 
 
322 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  27.27 
 
 
555 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  29.1 
 
 
305 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  21.63 
 
 
292 aa  55.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  31.08 
 
 
545 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  22.79 
 
 
338 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  31.25 
 
 
291 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  29.41 
 
 
534 aa  54.7  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  24.53 
 
 
344 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  31.16 
 
 
508 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  29.02 
 
 
325 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  26.34 
 
 
297 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  31.16 
 
 
508 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  27.81 
 
 
514 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  26.58 
 
 
513 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  24.39 
 
 
517 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  31.51 
 
 
588 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  27.9 
 
 
512 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  31.09 
 
 
292 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  27.9 
 
 
512 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  28.38 
 
 
522 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  31.25 
 
 
304 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  26.74 
 
 
505 aa  50.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  30.74 
 
 
318 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  33.04 
 
 
540 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  33.04 
 
 
540 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  33.04 
 
 
540 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  28.63 
 
 
364 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  31.6 
 
 
309 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  28.37 
 
 
510 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  29.6 
 
 
543 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  23.11 
 
 
347 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  23.51 
 
 
330 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  31.03 
 
 
258 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  24.9 
 
 
487 aa  47  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.64 
 
 
445 aa  47  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  26.24 
 
 
308 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  23.94 
 
 
523 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  26.03 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  28.47 
 
 
331 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  31.82 
 
 
292 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  26.61 
 
 
524 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  27.19 
 
 
291 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  23.85 
 
 
521 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  29.31 
 
 
495 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0458  adenylate cyclase  27.7 
 
 
211 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  30.99 
 
 
285 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>