128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1199 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  100 
 
 
920 aa  1867    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  30.84 
 
 
719 aa  127  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  33.9 
 
 
721 aa  125  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  28.62 
 
 
521 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  29.37 
 
 
524 aa  98.2  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  34.93 
 
 
520 aa  97.8  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  28.97 
 
 
331 aa  94.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  26.67 
 
 
344 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  26.69 
 
 
338 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  31.09 
 
 
523 aa  93.2  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  29.03 
 
 
322 aa  90.1  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  28.4 
 
 
318 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  27.2 
 
 
330 aa  89  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  30.65 
 
 
333 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  26.67 
 
 
347 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  26.02 
 
 
522 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  24.85 
 
 
636 aa  84.3  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  29.8 
 
 
517 aa  83.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  26.5 
 
 
523 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  30.03 
 
 
495 aa  82.4  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  31.36 
 
 
534 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  24.75 
 
 
555 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  30.96 
 
 
487 aa  79.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  30.04 
 
 
588 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  25.97 
 
 
558 aa  74.7  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  28.32 
 
 
598 aa  72.8  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  27.31 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  31.37 
 
 
512 aa  71.2  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  27.57 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  29.13 
 
 
540 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  29.13 
 
 
540 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  26.91 
 
 
358 aa  70.5  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  29.45 
 
 
512 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  29.45 
 
 
512 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  29.13 
 
 
540 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  28.31 
 
 
508 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  28.31 
 
 
508 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  30.21 
 
 
519 aa  69.3  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  27.76 
 
 
297 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  26.64 
 
 
292 aa  66.6  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  27.24 
 
 
310 aa  65.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  32.88 
 
 
309 aa  64.7  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  28.9 
 
 
467 aa  63.5  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  27.52 
 
 
511 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  30.64 
 
 
292 aa  62.4  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  26.59 
 
 
510 aa  62.4  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  28.45 
 
 
545 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  23.79 
 
 
297 aa  61.6  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  28.39 
 
 
545 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  26.8 
 
 
492 aa  61.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2960  hypothetical protein  28.72 
 
 
214 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.666408  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  26.21 
 
 
329 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  28.14 
 
 
543 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  29.2 
 
 
539 aa  60.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  27.17 
 
 
508 aa  60.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  26.3 
 
 
513 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  27.97 
 
 
511 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  28.74 
 
 
318 aa  60.1  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27.98 
 
 
504 aa  60.1  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  31.51 
 
 
325 aa  60.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  28.28 
 
 
492 aa  58.9  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  30.21 
 
 
265 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  28.63 
 
 
286 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  28.8 
 
 
292 aa  57.8  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  38.46 
 
 
506 aa  57.8  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  28.51 
 
 
688 aa  57.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  26.46 
 
 
527 aa  57  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  30.04 
 
 
514 aa  57.4  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  27.73 
 
 
329 aa  56.2  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  28.51 
 
 
691 aa  57  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  26.96 
 
 
522 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  28.51 
 
 
640 aa  57  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  28.51 
 
 
640 aa  57  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  28.51 
 
 
640 aa  57  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  48.39 
 
 
344 aa  57  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2560  hypothetical protein  27.35 
 
 
296 aa  55.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  24.83 
 
 
328 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  26.52 
 
 
512 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  29.05 
 
 
577 aa  55.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  28.51 
 
 
649 aa  55.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  26.64 
 
 
327 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  28.57 
 
 
313 aa  54.3  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  30.14 
 
 
285 aa  53.5  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  27.56 
 
 
291 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  24.73 
 
 
500 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  28.18 
 
 
505 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  28.63 
 
 
291 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  26.55 
 
 
285 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  24.87 
 
 
500 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  32.75 
 
 
510 aa  52.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  26.55 
 
 
292 aa  52.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  24.72 
 
 
596 aa  52.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.92 
 
 
445 aa  51.6  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0336  exopolyphosphatase-like protein  29.63 
 
 
504 aa  51.6  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  29.94 
 
 
272 aa  51.2  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  26.64 
 
 
277 aa  51.6  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  24.42 
 
 
304 aa  51.2  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  25.1 
 
 
325 aa  51.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  26.89 
 
 
495 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  27.17 
 
 
510 aa  50.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>