204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2370 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  100 
 
 
514 aa  1036    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  38.23 
 
 
520 aa  272  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  37.55 
 
 
511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  35.63 
 
 
513 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  39.1 
 
 
510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  38.76 
 
 
511 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  36.92 
 
 
512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  36.56 
 
 
596 aa  220  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  36.61 
 
 
512 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  36.42 
 
 
512 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  35.64 
 
 
505 aa  201  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  34.36 
 
 
490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  34.06 
 
 
508 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  34.19 
 
 
508 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  37.22 
 
 
494 aa  192  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  32.26 
 
 
508 aa  174  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  32.55 
 
 
510 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  30.75 
 
 
494 aa  161  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  31.7 
 
 
504 aa  160  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  31.44 
 
 
505 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  30.04 
 
 
519 aa  150  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  30.18 
 
 
499 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  30.17 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  29.67 
 
 
543 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  32.74 
 
 
540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  28.21 
 
 
519 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  30.4 
 
 
498 aa  123  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  31.03 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  32.93 
 
 
512 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  26.79 
 
 
505 aa  107  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  31.06 
 
 
508 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  27.11 
 
 
505 aa  106  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  32.79 
 
 
313 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  33.45 
 
 
512 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  34.36 
 
 
508 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  33.45 
 
 
512 aa  99.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  34.48 
 
 
508 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  39.63 
 
 
286 aa  99  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  27.48 
 
 
510 aa  98.2  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  33.88 
 
 
329 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  34.25 
 
 
498 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  33.56 
 
 
508 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  29.16 
 
 
539 aa  97.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  30.54 
 
 
518 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  31.53 
 
 
511 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  27.44 
 
 
529 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  27.02 
 
 
502 aa  94.7  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  32.1 
 
 
310 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  33.17 
 
 
321 aa  91.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  33.49 
 
 
500 aa  90.5  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  29.87 
 
 
521 aa  90.5  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  31.12 
 
 
508 aa  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  28.33 
 
 
518 aa  88.6  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  29.44 
 
 
327 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  26.8 
 
 
489 aa  87.8  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  26.8 
 
 
489 aa  87.8  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  30.45 
 
 
315 aa  87  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  36.54 
 
 
503 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  27.78 
 
 
318 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  31.7 
 
 
503 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  32.84 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  31.06 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  31.7 
 
 
503 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  35.44 
 
 
435 aa  84.7  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  33 
 
 
495 aa  84  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  31.28 
 
 
500 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  35.58 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  29.71 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  34.15 
 
 
503 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  30.2 
 
 
494 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  32.89 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1861  adenylate cyclase  27.83 
 
 
518 aa  80.1  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  30.41 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  29.83 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  29.83 
 
 
433 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  29.83 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  29.31 
 
 
433 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  35.1 
 
 
454 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  28.99 
 
 
433 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  29.72 
 
 
501 aa  77  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  34.91 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  30.73 
 
 
495 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  35.88 
 
 
321 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  31.91 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  31.91 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  31.91 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  27.73 
 
 
520 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  27.68 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  27.68 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  27.68 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  27.68 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  27.68 
 
 
433 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  27.68 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  27.23 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  33.18 
 
 
545 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  28.24 
 
 
510 aa  67.4  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  33.52 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  30.63 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  27.23 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2542  adenylate cyclase  31.48 
 
 
328 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>