106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1914 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1914  CHAD  100 
 
 		 313 aa  632  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  31.93 
 
 		 512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  31.63 
 
 		 512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  33.33 
 
 		 512 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  33.55 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  36.03 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  28.62 
 
 		 511 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  30.17 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  33.61 
 
 		 510 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  32.13 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  31.43 
 
 		 508 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  32.79 
 
 		 514 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  31.75 
 
 		 508 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  28.67 
 
 		 513 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  30.56 
 
 		 505 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  30.52 
 
 		 543 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  27.34 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  31.17 
 
 		 519 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  28.28 
 
 		 504 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  30.2 
 
 		 508 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  30 
 
 		 510 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 494 aa  88.6  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  28.73 
 
 		 487 aa  86.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.86 
 
 		 511 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  30.65 
 
 		 596 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  29.06 
 
 		 494 aa  79.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  27.69 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  34.91 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  34.91 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  34.91 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  32.86 
 
 		 588 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  30.33 
 
 		 545 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  30.2 
 
 		 545 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  30.61 
 
 		 543 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  29.96 
 
 		 520 aa  69.3  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  30.29 
 
 		 577 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  28.75 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  28.57 
 
 		 920 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  28.75 
 
 		 691 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  28.75 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  28.75 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  28.75 
 
 		 649 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  28.75 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  25.63 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  28.37 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  27.44 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  26.32 
 
 		 490 aa  59.3  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  25.41 
 
 		 518 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  29.22 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  27.53 
 
 		 643 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  29.8 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  27.08 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  27.39 
 
 		 499 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  28.47 
 
 		 521 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  27.17 
 
 		 555 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  25.36 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  26.69 
 
 		 509 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  29.48 
 
 		 510 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  25 
 
 		 523 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  28.86 
 
 		 512 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  23.44 
 
 		 519 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  27.39 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  25.97 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  30.17 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  27.12 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  29.74 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  25 
 
 		 505 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  25.37 
 
 		 467 aa  50.8  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  29.39 
 
 		 496 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  28.32 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  28.19 
 
 		 505 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  27.49 
 
 		 524 aa  49.7  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  25.45 
 
 		 598 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  28.08 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  30.43 
 
 		 520 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  25.81 
 
 		 492 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  25.81 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  28.81 
 
 		 512 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  25.58 
 
 		 721 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  28.07 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  24.68 
 
 		 523 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  28.1 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  28.7 
 
 		 517 aa  46.6  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  24.53 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  29.2 
 
 		 540 aa  45.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  25.58 
 
 		 719 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  26.1 
 
 		 518 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  23.29 
 
 		 527 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  27.83 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  41.79 
 
 		 492 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  26.19 
 
 		 539 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  24.14 
 
 		 544 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  27.27 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  29.7 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  24.28 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  26.58 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  24.81 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 		 852 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  26.61 
 
 		 505 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  27.19 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>