More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2578 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
506 aa  1030    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  42.32 
 
 
507 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  34.33 
 
 
502 aa  353  5.9999999999999994e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  37.1 
 
 
500 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  36.65 
 
 
500 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  37.45 
 
 
502 aa  342  7e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  38.65 
 
 
497 aa  342  8e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  37.45 
 
 
502 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  34.33 
 
 
501 aa  340  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  29.96 
 
 
502 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  31.61 
 
 
501 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  28.88 
 
 
520 aa  236  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  30.18 
 
 
513 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  29.59 
 
 
534 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  30.6 
 
 
519 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  29.43 
 
 
513 aa  226  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  30.08 
 
 
513 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  30.14 
 
 
521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  30.49 
 
 
553 aa  213  9e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  30.83 
 
 
488 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  29.79 
 
 
544 aa  209  9e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  28.12 
 
 
510 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  28.71 
 
 
519 aa  206  7e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  31.25 
 
 
545 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  31.25 
 
 
545 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  29.49 
 
 
512 aa  203  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  29.74 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  29.74 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  29.74 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  31.18 
 
 
491 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  29.74 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  28.63 
 
 
521 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  29.39 
 
 
570 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  29.74 
 
 
512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  30.23 
 
 
527 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  29.42 
 
 
549 aa  201  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  28.91 
 
 
523 aa  199  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  30.48 
 
 
550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  29.74 
 
 
511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  29.33 
 
 
524 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  36.3 
 
 
321 aa  197  5.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  29.53 
 
 
512 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  31.08 
 
 
519 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.49 
 
 
524 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  32.33 
 
 
482 aa  193  5e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  34.74 
 
 
312 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  28.54 
 
 
519 aa  190  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  28.02 
 
 
524 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  34.64 
 
 
326 aa  189  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  28.12 
 
 
505 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  28.37 
 
 
514 aa  187  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  28.06 
 
 
519 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0978  fumarate reductase  29.31 
 
 
482 aa  187  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0786435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  30.61 
 
 
550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  28.84 
 
 
505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  31.05 
 
 
549 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  29.37 
 
 
510 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  28.97 
 
 
511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  27.02 
 
 
532 aa  179  9e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  34.97 
 
 
323 aa  179  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  28.12 
 
 
511 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  29.34 
 
 
531 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  28.74 
 
 
531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  28.78 
 
 
482 aa  171  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  29.11 
 
 
531 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0334  exopolyphosphatase  31.27 
 
 
307 aa  171  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  29.25 
 
 
557 aa  170  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  29.11 
 
 
531 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  30.75 
 
 
544 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  30.75 
 
 
544 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  28.18 
 
 
545 aa  167  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  27.79 
 
 
539 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  29.58 
 
 
492 aa  163  6e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0402  Ppx/GppA family phosphatase  28.48 
 
 
486 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.719278  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  28.74 
 
 
489 aa  162  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1606  Ppx/GppA family phosphatase  28.48 
 
 
486 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0377  Ppx/GppA family phosphatase  28.48 
 
 
486 aa  162  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  29.66 
 
 
498 aa  158  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  27.29 
 
 
548 aa  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  28.09 
 
 
501 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  25.34 
 
 
508 aa  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  28.33 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  28.33 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  27.12 
 
 
500 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.22 
 
 
498 aa  146  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.22 
 
 
498 aa  146  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.22 
 
 
498 aa  146  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  26.75 
 
 
529 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0434  Ppx/GppA phosphatase  27.63 
 
 
507 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  32.26 
 
 
305 aa  144  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.25 
 
 
498 aa  144  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  27.6 
 
 
500 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  27.12 
 
 
504 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  26.56 
 
 
504 aa  143  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  27.6 
 
 
500 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  25.43 
 
 
506 aa  143  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  33.22 
 
 
303 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  26.13 
 
 
509 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  25.97 
 
 
506 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  27.85 
 
 
500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>