105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4305 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  100 
 
 
358 aa  705    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  31.85 
 
 
598 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  38.25 
 
 
510 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  30.86 
 
 
490 aa  84.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  33.68 
 
 
520 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  27.4 
 
 
524 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  33.47 
 
 
495 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  29.6 
 
 
505 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  30.51 
 
 
527 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  29.75 
 
 
721 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  32.61 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  26.1 
 
 
920 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  29.27 
 
 
719 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  29.24 
 
 
517 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  30.62 
 
 
492 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  28.51 
 
 
523 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  27.68 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  28.69 
 
 
521 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  26.3 
 
 
505 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  33.48 
 
 
496 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  35.37 
 
 
544 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  30.89 
 
 
512 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  26.46 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  28.08 
 
 
517 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  25.09 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  25.94 
 
 
508 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  29.55 
 
 
534 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  30.19 
 
 
519 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  29.39 
 
 
487 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  27.8 
 
 
508 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  25.84 
 
 
523 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  28.11 
 
 
509 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  31.51 
 
 
540 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  31.51 
 
 
540 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  31.51 
 
 
540 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  28.16 
 
 
508 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  25.94 
 
 
347 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  29.37 
 
 
510 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  30.42 
 
 
545 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  27.33 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  23.83 
 
 
467 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  27.9 
 
 
364 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  30.94 
 
 
325 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  32.55 
 
 
285 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  31.78 
 
 
577 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  31.15 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  29.51 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  26.62 
 
 
555 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  28.2 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  34.23 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  24.44 
 
 
519 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  30.59 
 
 
596 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  26.86 
 
 
513 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  28.63 
 
 
518 aa  54.3  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  28.1 
 
 
588 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  26.57 
 
 
558 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  29.14 
 
 
539 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  33.72 
 
 
265 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  32.06 
 
 
522 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  32.4 
 
 
494 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  32.53 
 
 
514 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  29.82 
 
 
286 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  35.19 
 
 
681 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  27.94 
 
 
502 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  27.94 
 
 
502 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  27.94 
 
 
502 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  29.22 
 
 
545 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  27.34 
 
 
512 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  31.43 
 
 
509 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  27.54 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  30.45 
 
 
688 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  28.87 
 
 
543 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  30.45 
 
 
640 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  30.45 
 
 
640 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  30.45 
 
 
640 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  24.51 
 
 
322 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  25.49 
 
 
504 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  28.64 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  28.7 
 
 
344 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  30.45 
 
 
691 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  30.45 
 
 
649 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  27.05 
 
 
511 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  29.44 
 
 
513 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  26.41 
 
 
304 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  42.19 
 
 
636 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  26.29 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  29.09 
 
 
277 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  29.28 
 
 
490 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  32.02 
 
 
508 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  28.27 
 
 
308 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  30.91 
 
 
643 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  24.1 
 
 
522 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  27.8 
 
 
327 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  28.31 
 
 
305 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  26.12 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  28.05 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  26.64 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  24.09 
 
 
310 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  23.27 
 
 
330 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  27.98 
 
 
253 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>