60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2640 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 297 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  56.27 
 
 		 297 aa  318  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2560  hypothetical protein  49.49 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  45.02 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  39.55 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  39.58 
 
 		 325 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  31.6 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  30.4 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  31.62 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  27.76 
 
 		 920 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  28.14 
 
 		 721 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  25.8 
 
 		 719 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  25.64 
 
 		 521 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  31.25 
 
 		 527 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  26.27 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  26.14 
 
 		 636 aa  55.8  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  26.81 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  24.49 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  28.32 
 
 		 596 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  26.73 
 
 		 514 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  28.12 
 
 		 505 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  27.35 
 
 		 511 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  28.57 
 
 		 512 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  42.62 
 
 		 681 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  24.79 
 
 		 524 aa  49.3  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  28.24 
 
 		 522 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  28.35 
 
 		 499 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  28.94 
 
 		 511 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  28.19 
 
 		 555 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  25.57 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  26.29 
 
 		 558 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  28.17 
 
 		 512 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  25.99 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  21.89 
 
 		 330 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  27.57 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  28.57 
 
 		 540 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  23.81 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  28.06 
 
 		 512 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  21.19 
 
 		 344 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  31.13 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  26.13 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  26.46 
 
 		 510 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0571  CHAD domain-containing protein  43.86 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  23.35 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  27.73 
 
 		 522 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  29.49 
 
 		 505 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  25.11 
 
 		 504 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  25.42 
 
 		 513 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  27.35 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  29.87 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  30.3 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  25.97 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  27.65 
 
 		 508 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  25.74 
 
 		 508 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0467  hypothetical protein  50 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  29.11 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  22.36 
 
 		 519 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  26.85 
 
 		 508 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  23.79 
 
 		 523 aa  42.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  24.44 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>