214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3081 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  99.02 
 
 		 512 aa  994    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 512 aa  1003    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  89.06 
 
 		 512 aa  879    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  58.37 
 
 		 513 aa  569  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  61.36 
 
 		 511 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  58.45 
 
 		 511 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  49.52 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  40.54 
 
 		 490 aa  276  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  38.96 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  37.37 
 
 		 596 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  38.03 
 
 		 494 aa  234  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  33.68 
 
 		 487 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  36.42 
 
 		 514 aa  221  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  36.69 
 
 		 508 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  34.1 
 
 		 519 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  34.67 
 
 		 508 aa  213  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  36.74 
 
 		 508 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  34.66 
 
 		 494 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  34.99 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  36.2 
 
 		 540 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  34.67 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  31.26 
 
 		 543 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  32.47 
 
 		 499 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  33.05 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  33.13 
 
 		 505 aa  163  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  33.87 
 
 		 498 aa  156  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  36.33 
 
 		 329 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  36.43 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  31.8 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  28.19 
 
 		 519 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  36.93 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  33.54 
 
 		 509 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  36.67 
 
 		 328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  29.95 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  37.15 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  34.01 
 
 		 508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  31.93 
 
 		 313 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  34.59 
 
 		 435 aa  120  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  30.69 
 
 		 510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  32.45 
 
 		 539 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  34.18 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  31.02 
 
 		 529 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  32.87 
 
 		 503 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  33.57 
 
 		 503 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  33.22 
 
 		 508 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  31.2 
 
 		 318 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.94 
 
 		 521 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  33.45 
 
 		 508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  32.77 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  33.01 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  33.01 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  33.22 
 
 		 503 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  33.57 
 
 		 503 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  33.01 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  32.75 
 
 		 494 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  27.01 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  33.82 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  33.82 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  34.41 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  31.87 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  33.69 
 
 		 508 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  30.82 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  33.45 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  33.45 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  33.45 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  33.45 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  33.45 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  32.33 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  27.7 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  30.68 
 
 		 443 aa  109  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  33.09 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  37 
 
 		 498 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  34.65 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  32.76 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  30.09 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  32.16 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  31.43 
 
 		 500 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  32.16 
 
 		 433 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  36.18 
 
 		 347 aa  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  32.16 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  32.66 
 
 		 512 aa  103  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  33.46 
 
 		 443 aa  103  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  36.29 
 
 		 292 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  36.89 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  31.8 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  31.91 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  32.16 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  37.92 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  32.25 
 
 		 512 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  33.73 
 
 		 445 aa  100  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  39.41 
 
 		 321 aa  97.8  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  40.5 
 
 		 291 aa  97.1  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  37.5 
 
 		 286 aa  97.1  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  30.93 
 
 		 321 aa  96.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1861  adenylate cyclase  25.95 
 
 		 518 aa  96.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  32.04 
 
 		 520 aa  94.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2542  adenylate cyclase  35.27 
 
 		 328 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  30.77 
 
 		 510 aa  87.4  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  37.38 
 
 		 721 aa  87  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  40.22 
 
 		 207 aa  87  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>