134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2018 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  71.57 
 
 
510 aa  766    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  61.39 
 
 
505 aa  649    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  1039    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  72.16 
 
 
529 aa  729    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  34.12 
 
 
502 aa  294  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  39.46 
 
 
435 aa  292  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  38.67 
 
 
433 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  38.67 
 
 
433 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  38.67 
 
 
433 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  38.67 
 
 
433 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  38.67 
 
 
433 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  37.34 
 
 
443 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  36.67 
 
 
433 aa  277  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  37.71 
 
 
433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  37.5 
 
 
433 aa  274  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  37.5 
 
 
433 aa  274  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  37.5 
 
 
433 aa  274  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  37.5 
 
 
433 aa  274  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  37.29 
 
 
433 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  36.03 
 
 
445 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  37.29 
 
 
433 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  37.08 
 
 
433 aa  270  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  38.34 
 
 
433 aa  270  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  38.44 
 
 
435 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  38.44 
 
 
435 aa  267  4e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  38.44 
 
 
435 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  34.92 
 
 
443 aa  264  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  33.78 
 
 
500 aa  256  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  35.31 
 
 
503 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  33.27 
 
 
495 aa  247  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  34.11 
 
 
495 aa  246  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  34.79 
 
 
503 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  34.22 
 
 
503 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  32.81 
 
 
494 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  34.17 
 
 
508 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0798  adenylate cyclase  34.72 
 
 
443 aa  237  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  33.4 
 
 
508 aa  237  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  34.73 
 
 
503 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  34.23 
 
 
498 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  34.29 
 
 
500 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  33.91 
 
 
508 aa  233  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  33.78 
 
 
508 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  29.78 
 
 
501 aa  231  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  32.95 
 
 
492 aa  219  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  40.36 
 
 
495 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  29.57 
 
 
535 aa  193  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  42.13 
 
 
321 aa  174  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  40.57 
 
 
347 aa  158  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  31.95 
 
 
510 aa  146  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  32.58 
 
 
512 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  29.98 
 
 
508 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  29.63 
 
 
508 aa  143  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  29.23 
 
 
519 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  31.47 
 
 
512 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  32.85 
 
 
511 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  31.47 
 
 
512 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  37.76 
 
 
508 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  30.95 
 
 
490 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  26.95 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  30.29 
 
 
494 aa  128  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  32.08 
 
 
511 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  28.3 
 
 
513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  29.45 
 
 
540 aa  120  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  32.67 
 
 
321 aa  118  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  32.71 
 
 
505 aa  118  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  43.27 
 
 
211 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  27.56 
 
 
505 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  28.97 
 
 
487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  38.73 
 
 
499 aa  114  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2542  adenylate cyclase  38.28 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  27.66 
 
 
596 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  25.63 
 
 
508 aa  109  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  42.69 
 
 
215 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  42.69 
 
 
215 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  42.69 
 
 
213 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  26.79 
 
 
514 aa  107  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  29.28 
 
 
489 aa  106  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  29.28 
 
 
489 aa  106  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  35.66 
 
 
291 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  42.11 
 
 
213 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  42.11 
 
 
213 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  42.11 
 
 
213 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  42.11 
 
 
213 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  43.6 
 
 
208 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  31.9 
 
 
315 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  41.81 
 
 
213 aa  103  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  25.6 
 
 
504 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0322  adenylate cyclase  32.18 
 
 
471 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0252  adenylate cyclase  33.51 
 
 
484 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  41.11 
 
 
208 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  35.29 
 
 
286 aa  99.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  30.29 
 
 
543 aa  99  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68810  hypothetical protein  31.12 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0276  adenylate cyclase  31.35 
 
 
458 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5954  hypothetical protein  30.35 
 
 
454 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74746  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  33.46 
 
 
518 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  33.78 
 
 
454 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  38.51 
 
 
208 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  38.51 
 
 
208 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1861  adenylate cyclase  31.62 
 
 
518 aa  94  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0847952 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>