133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2680 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  1036    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  61.39 
 
 
505 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  61.96 
 
 
510 aa  623  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  62.94 
 
 
529 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  33.93 
 
 
502 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  34.2 
 
 
443 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  35.27 
 
 
435 aa  250  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  34.13 
 
 
445 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  34.42 
 
 
492 aa  243  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  34 
 
 
433 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  31.54 
 
 
503 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  31.92 
 
 
503 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  31.35 
 
 
503 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  31.15 
 
 
503 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  31.7 
 
 
494 aa  236  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  34.44 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  34.44 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  34.44 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  34.44 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  34.44 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  34.44 
 
 
433 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  34.37 
 
 
433 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  34.37 
 
 
433 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  34.37 
 
 
433 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  34 
 
 
435 aa  233  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  34 
 
 
435 aa  233  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  34 
 
 
435 aa  233  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  34.37 
 
 
433 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  34.37 
 
 
433 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  34.22 
 
 
433 aa  232  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  34.22 
 
 
433 aa  232  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  31.8 
 
 
508 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  30.96 
 
 
508 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  34.57 
 
 
433 aa  227  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  30.77 
 
 
498 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  30.33 
 
 
443 aa  224  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  30.77 
 
 
508 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  29.16 
 
 
495 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  30.58 
 
 
508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  30.95 
 
 
495 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  30.34 
 
 
500 aa  210  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  30.62 
 
 
500 aa  206  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0798  adenylate cyclase  31.22 
 
 
443 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  27.9 
 
 
501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  39.56 
 
 
495 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  30.04 
 
 
535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  38.37 
 
 
321 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  40.29 
 
 
347 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  28.47 
 
 
508 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  28.22 
 
 
508 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  26.73 
 
 
510 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  30.18 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  35.39 
 
 
508 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  29.95 
 
 
512 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  25.79 
 
 
519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  29.49 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  31.14 
 
 
511 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  31.99 
 
 
490 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  42.53 
 
 
211 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  31.65 
 
 
511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  31.4 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  28.68 
 
 
505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  28.57 
 
 
494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  36.45 
 
 
505 aa  111  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  37.32 
 
 
499 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  30.96 
 
 
487 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  26.98 
 
 
540 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  27.11 
 
 
514 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  27.15 
 
 
508 aa  103  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  27.29 
 
 
513 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  34.4 
 
 
291 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  27.67 
 
 
489 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  27.67 
 
 
489 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  41.04 
 
 
215 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  41.04 
 
 
215 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  28.65 
 
 
321 aa  101  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  41.04 
 
 
213 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  41.04 
 
 
213 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  41.24 
 
 
208 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  41.04 
 
 
213 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  41.04 
 
 
213 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  41.04 
 
 
213 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  40.72 
 
 
286 aa  97.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0322  adenylate cyclase  30.7 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  35.02 
 
 
219 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  31.52 
 
 
315 aa  94.4  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  39.88 
 
 
213 aa  93.6  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  28.77 
 
 
494 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  26.6 
 
 
596 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  29.64 
 
 
543 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0252  adenylate cyclase  31.38 
 
 
484 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  28.44 
 
 
518 aa  91.3  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2542  adenylate cyclase  36.36 
 
 
328 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  34.72 
 
 
208 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  35.63 
 
 
208 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  35.63 
 
 
208 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1861  adenylate cyclase  29.2 
 
 
518 aa  88.2  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  35.84 
 
 
219 aa  87.8  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  30.26 
 
 
521 aa  87  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  35.06 
 
 
208 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>