127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4196 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  100 
 
 
535 aa  1087    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  31.25 
 
 
510 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  29.57 
 
 
505 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  30.04 
 
 
505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  30.7 
 
 
529 aa  198  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  29.34 
 
 
495 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  27.99 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  25.42 
 
 
501 aa  167  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  29.5 
 
 
500 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  30.88 
 
 
492 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  27.54 
 
 
508 aa  156  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  26.95 
 
 
508 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  27.17 
 
 
498 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  28.94 
 
 
502 aa  153  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  26.21 
 
 
508 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  26.75 
 
 
508 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  27.17 
 
 
503 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  29.13 
 
 
503 aa  147  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  37.4 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  35.06 
 
 
445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  27.63 
 
 
503 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  33.59 
 
 
494 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  40 
 
 
433 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  40 
 
 
433 aa  140  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  40 
 
 
433 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  40 
 
 
433 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  40 
 
 
433 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  27.45 
 
 
503 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  40 
 
 
433 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  40 
 
 
433 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  33.82 
 
 
443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  32.49 
 
 
435 aa  138  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  39.53 
 
 
433 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  39.53 
 
 
433 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  38.81 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  34.07 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  37.96 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  38.25 
 
 
433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  39.25 
 
 
435 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  39.25 
 
 
435 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  39.25 
 
 
435 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  36.16 
 
 
433 aa  129  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  38.36 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  39.34 
 
 
500 aa  128  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  40.8 
 
 
495 aa  127  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0798  adenylate cyclase  35.4 
 
 
443 aa  127  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  37.97 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  37.16 
 
 
215 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  36.96 
 
 
213 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  37.16 
 
 
215 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  39.43 
 
 
211 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  36.76 
 
 
213 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  32.64 
 
 
499 aa  94  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  36.76 
 
 
213 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  36.76 
 
 
213 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  36.76 
 
 
213 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  33.94 
 
 
347 aa  93.6  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  36.36 
 
 
208 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  27.56 
 
 
512 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  33 
 
 
511 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  35.87 
 
 
213 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  34.56 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  37.29 
 
 
208 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  29.2 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  29.49 
 
 
494 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  33.33 
 
 
207 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  35.68 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  33.92 
 
 
489 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  33.92 
 
 
489 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  22.96 
 
 
512 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3027  adenylate cyclase  30.8 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0441666  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  34.86 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  34.86 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  34.86 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  25 
 
 
512 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  31.51 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  32.62 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  27.47 
 
 
505 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  29.95 
 
 
219 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  31.91 
 
 
219 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  27.82 
 
 
490 aa  74.7  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0435  adenylate cyclase  34.86 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0459  adenylate cyclase  34.86 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.211373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  26.23 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  29.44 
 
 
510 aa  70.5  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  32.4 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  28.94 
 
 
540 aa  67.4  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  32.24 
 
 
519 aa  67.4  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  26.64 
 
 
513 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2864  adenylate cyclase  34.08 
 
 
208 aa  67  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39702  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  28.47 
 
 
518 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  30.34 
 
 
519 aa  65.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  31.66 
 
 
508 aa  64.3  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  28.1 
 
 
520 aa  63.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2886  hypothetical protein  27.83 
 
 
223 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0322  adenylate cyclase  36.31 
 
 
471 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5247  adenylate cyclase  36.52 
 
 
455 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  30.62 
 
 
512 aa  60.1  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  28.57 
 
 
514 aa  60.1  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  30.14 
 
 
512 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>