136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3462 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  84.99 
 
 
433 aa  744    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  84.99 
 
 
433 aa  744    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  98.38 
 
 
433 aa  877    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  100 
 
 
433 aa  890    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  84.99 
 
 
433 aa  744    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  85.68 
 
 
433 aa  750    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  75.06 
 
 
433 aa  654    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  85.22 
 
 
433 aa  746    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  99.08 
 
 
433 aa  881    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  98.85 
 
 
433 aa  877    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  84.76 
 
 
433 aa  741    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  85.22 
 
 
433 aa  762    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  98.85 
 
 
433 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  84.99 
 
 
433 aa  744    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  85.22 
 
 
433 aa  752    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  53.56 
 
 
435 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  49.1 
 
 
445 aa  405  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  49.43 
 
 
435 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  49.43 
 
 
435 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  49.43 
 
 
435 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  48.31 
 
 
443 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  47.51 
 
 
443 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0798  adenylate cyclase  47.45 
 
 
443 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  38.67 
 
 
505 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  37.94 
 
 
529 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  36.7 
 
 
510 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  34.37 
 
 
505 aa  232  9e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  41.11 
 
 
495 aa  192  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  42.57 
 
 
508 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  39.46 
 
 
500 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  42.17 
 
 
498 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  42.17 
 
 
508 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  41.77 
 
 
508 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  39.59 
 
 
495 aa  172  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  38.27 
 
 
494 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  41.27 
 
 
508 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  41.98 
 
 
492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  36.01 
 
 
502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  43.41 
 
 
503 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  41.15 
 
 
495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  37.07 
 
 
500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  43.41 
 
 
503 aa  160  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  38.52 
 
 
321 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  42.44 
 
 
503 aa  156  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  42.44 
 
 
503 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  36.03 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  38.83 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  33.7 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  37.2 
 
 
499 aa  113  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  34.1 
 
 
540 aa  111  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  34.3 
 
 
508 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  39.71 
 
 
291 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  35.68 
 
 
213 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  35.68 
 
 
213 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  35.68 
 
 
213 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  35.68 
 
 
213 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  35.68 
 
 
213 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  35.82 
 
 
494 aa  106  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3027  adenylate cyclase  42.44 
 
 
206 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0441666  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  31.32 
 
 
512 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  35.85 
 
 
519 aa  103  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  30 
 
 
490 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  30.1 
 
 
487 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  34.22 
 
 
454 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  35.35 
 
 
215 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  32.16 
 
 
512 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  35.35 
 
 
215 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0322  adenylate cyclase  29.7 
 
 
471 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  35.12 
 
 
208 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  36.36 
 
 
213 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  33.19 
 
 
505 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  32.16 
 
 
512 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  37.91 
 
 
510 aa  100  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  34.63 
 
 
208 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  34.63 
 
 
208 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  31.54 
 
 
511 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  30 
 
 
513 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  35.12 
 
 
489 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  35.12 
 
 
489 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  35.41 
 
 
208 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  34.63 
 
 
211 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  29.03 
 
 
315 aa  94  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  33.33 
 
 
208 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0252  adenylate cyclase  30.6 
 
 
484 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  32.39 
 
 
511 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  35.07 
 
 
219 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  34.6 
 
 
219 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  33.33 
 
 
208 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0435  adenylate cyclase  32.37 
 
 
208 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  29.6 
 
 
505 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0459  adenylate cyclase  32.37 
 
 
208 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.211373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  29.58 
 
 
596 aa  87.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  36.99 
 
 
511 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5954  hypothetical protein  28.57 
 
 
454 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  26.95 
 
 
510 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  33.17 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5247  adenylate cyclase  38.39 
 
 
455 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5421  adenylate cyclase  37.32 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274372  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  35 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0276  adenylate cyclase  37.44 
 
 
458 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.817849 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>