205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3355 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  100 
 
 
487 aa  990    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  39.23 
 
 
509 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  31.69 
 
 
519 aa  231  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  34.16 
 
 
512 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  35.12 
 
 
511 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  33.88 
 
 
512 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  33.68 
 
 
512 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  36.29 
 
 
505 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  32.86 
 
 
508 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  33.76 
 
 
513 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  32.38 
 
 
508 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  32.84 
 
 
511 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  34.1 
 
 
499 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  34.85 
 
 
508 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  32.86 
 
 
505 aa  195  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  33.93 
 
 
540 aa  193  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  32.47 
 
 
494 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  32.98 
 
 
490 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  31.25 
 
 
596 aa  173  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  30.19 
 
 
510 aa  170  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  29.21 
 
 
508 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  31.97 
 
 
494 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  29.96 
 
 
504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  29.75 
 
 
514 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  30.17 
 
 
520 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  29.9 
 
 
498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  34.59 
 
 
292 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  28.3 
 
 
521 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  30.92 
 
 
511 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  31.15 
 
 
512 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  29.97 
 
 
318 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  31.75 
 
 
433 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  37.68 
 
 
213 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  37.2 
 
 
213 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  37.2 
 
 
213 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  37.2 
 
 
213 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  37.2 
 
 
213 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  30.94 
 
 
512 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  32.46 
 
 
543 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  34.32 
 
 
291 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  31.88 
 
 
495 aa  115  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  28.97 
 
 
505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  36.71 
 
 
215 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  30.29 
 
 
433 aa  114  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  36.71 
 
 
215 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  30.29 
 
 
433 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  30.29 
 
 
433 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  30.29 
 
 
433 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  30.29 
 
 
433 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  30.29 
 
 
433 aa  113  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  31.02 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  25.85 
 
 
519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  29.93 
 
 
433 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  37.2 
 
 
208 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  37.2 
 
 
208 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  34.54 
 
 
588 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  37.2 
 
 
208 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  33.33 
 
 
503 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  36.02 
 
 
208 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  30.96 
 
 
505 aa  108  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  31.94 
 
 
443 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  33.82 
 
 
508 aa  107  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  28.28 
 
 
501 aa  107  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  34.31 
 
 
347 aa  107  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  29.06 
 
 
512 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  26.24 
 
 
489 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  37.2 
 
 
208 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  32.85 
 
 
508 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  33.49 
 
 
503 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  26.24 
 
 
489 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  32.85 
 
 
508 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  32.85 
 
 
508 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  38.24 
 
 
207 aa  104  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  30.1 
 
 
433 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  35.75 
 
 
213 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  30.45 
 
 
433 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  30.58 
 
 
433 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  32.37 
 
 
498 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  33.01 
 
 
503 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  30.1 
 
 
433 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  30.94 
 
 
510 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  33.6 
 
 
543 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  33.01 
 
 
503 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  30.1 
 
 
433 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  33.2 
 
 
545 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  35.32 
 
 
540 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  35.32 
 
 
540 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  35.32 
 
 
540 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  27.9 
 
 
502 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  31.67 
 
 
500 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  32.75 
 
 
435 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  32.75 
 
 
435 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  33.98 
 
 
211 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  32.75 
 
 
435 aa  100  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  33.98 
 
 
494 aa  99.8  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  33.06 
 
 
577 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  34.13 
 
 
208 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  34.29 
 
 
219 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3027  adenylate cyclase  38.12 
 
 
206 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0441666  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  31.85 
 
 
545 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>