132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3182 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3027  adenylate cyclase  71.43 
 
 		 206 aa  258  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0441666  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  50.95 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  51.43 
 
 		 219 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2886  hypothetical protein  52.34 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  48.11 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  47.64 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  47.64 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  47.64 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  47.64 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  48.13 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  48.13 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  48.11 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  42.92 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  41.51 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  42.25 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  42.45 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  42.45 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  42.45 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  40.76 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0435  adenylate cyclase  40.28 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0459  adenylate cyclase  41.23 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.211373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2864  adenylate cyclase  41.23 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39702  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  37.5 
 
 		 508 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  38.24 
 
 		 487 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  37.02 
 
 		 495 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  37.5 
 
 		 508 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  36.32 
 
 		 508 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  35 
 
 		 315 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  37.98 
 
 		 508 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  42.13 
 
 		 454 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  37.74 
 
 		 503 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  36.54 
 
 		 498 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  37.74 
 
 		 503 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  38.03 
 
 		 321 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  36.71 
 
 		 433 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  41.28 
 
 		 540 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  36.71 
 
 		 435 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  36.71 
 
 		 435 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  36.71 
 
 		 435 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  37.26 
 
 		 503 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  36.23 
 
 		 433 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  38.86 
 
 		 519 aa  99.8  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  35.75 
 
 		 433 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  39.9 
 
 		 512 aa  99  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  35.75 
 
 		 433 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  35.75 
 
 		 433 aa  99  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  41.38 
 
 		 508 aa  98.6  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  35.75 
 
 		 433 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  35.75 
 
 		 433 aa  99  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  36.79 
 
 		 503 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  41.01 
 
 		 512 aa  98.2  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  38.21 
 
 		 499 aa  98.2  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  35.75 
 
 		 433 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  35.75 
 
 		 433 aa  97.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  35.24 
 
 		 495 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  37.98 
 
 		 505 aa  96.7  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5954  hypothetical protein  38.74 
 
 		 454 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  41.34 
 
 		 511 aa  96.3  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  37.14 
 
 		 435 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  45.63 
 
 		 291 aa  95.1  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  36.71 
 
 		 286 aa  94.7  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  36.79 
 
 		 505 aa  94.7  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  41.44 
 
 		 512 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  39.09 
 
 		 505 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  35.27 
 
 		 433 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  35.27 
 
 		 433 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 500 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  35.27 
 
 		 433 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  35.27 
 
 		 433 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  35.27 
 
 		 433 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68810  hypothetical protein  38.29 
 
 		 454 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  39.34 
 
 		 512 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  32.55 
 
 		 494 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  32.86 
 
 		 500 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  39.34 
 
 		 512 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  34.74 
 
 		 494 aa  89.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  35.05 
 
 		 529 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  37.14 
 
 		 492 aa  88.2  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  37.5 
 
 		 520 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  35.26 
 
 		 502 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  35.75 
 
 		 433 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  38.46 
 
 		 511 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5421  adenylate cyclase  41.14 
 
 		 456 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274372  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  30.7 
 
 		 535 aa  84.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5187  adenylate cyclase  37.44 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  39.13 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5094  adenylate cyclase  37.44 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5247  adenylate cyclase  36.99 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0322  adenylate cyclase  38.75 
 
 		 471 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  34.43 
 
 		 445 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  32.87 
 
 		 510 aa  82  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  40.23 
 
 		 489 aa  81.6  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  40.23 
 
 		 489 aa  81.6  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0798  adenylate cyclase  33.96 
 
 		 443 aa  81.6  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0276  adenylate cyclase  39.56 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0252  adenylate cyclase  36.89 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  33.96 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  34.64 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  31.13 
 
 		 495 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>