136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3027 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3027  adenylate cyclase  100 
 
 
206 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0441666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  71.43 
 
 
207 aa  248  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  51.43 
 
 
219 aa  187  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  51.43 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2886  hypothetical protein  51.87 
 
 
223 aa  177  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  48.36 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  48.36 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  48.36 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  48.36 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  48.36 
 
 
213 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  47.44 
 
 
215 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  47.44 
 
 
215 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  48.11 
 
 
213 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  43.06 
 
 
211 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  42.38 
 
 
208 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  44.98 
 
 
208 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  44.98 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  44.98 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  41.43 
 
 
208 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  43.27 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0459  adenylate cyclase  43.33 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.211373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0435  adenylate cyclase  42.86 
 
 
208 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  42.44 
 
 
433 aa  117  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  42.44 
 
 
433 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  42.44 
 
 
433 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  42.44 
 
 
433 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  41.95 
 
 
433 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  42.44 
 
 
433 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  41.95 
 
 
433 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  41.95 
 
 
433 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  41.95 
 
 
433 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  41.95 
 
 
433 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  41.95 
 
 
433 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  41.46 
 
 
433 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  41.95 
 
 
433 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  41.95 
 
 
433 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  37.5 
 
 
495 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2864  adenylate cyclase  42.58 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39702  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  38.12 
 
 
487 aa  111  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  39.61 
 
 
508 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  39.61 
 
 
508 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  41.95 
 
 
433 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  39.13 
 
 
508 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  39.13 
 
 
508 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  38.16 
 
 
498 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  42.57 
 
 
508 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  39.34 
 
 
499 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  41.63 
 
 
454 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  38.5 
 
 
540 aa  101  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  38.65 
 
 
503 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  38.65 
 
 
503 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  38.16 
 
 
286 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  38.65 
 
 
503 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  36.23 
 
 
503 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  37.98 
 
 
321 aa  96.3  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  43.56 
 
 
291 aa  96.3  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  40.38 
 
 
520 aa  95.9  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  33.65 
 
 
435 aa  95.9  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  33.65 
 
 
435 aa  95.9  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  33.65 
 
 
435 aa  95.9  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  32.72 
 
 
315 aa  95.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  33.81 
 
 
502 aa  94  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  44.25 
 
 
511 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  31.53 
 
 
535 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  35.58 
 
 
519 aa  93.2  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5954  hypothetical protein  39.34 
 
 
454 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  35.1 
 
 
435 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  34.78 
 
 
495 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  33.97 
 
 
500 aa  93.2  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  40.38 
 
 
512 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  34.45 
 
 
500 aa  93.2  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  36.89 
 
 
505 aa  92.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  40.47 
 
 
512 aa  92  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  33.33 
 
 
494 aa  91.7  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  33.82 
 
 
494 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  36.62 
 
 
505 aa  90.5  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  39.62 
 
 
512 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  38.42 
 
 
509 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5421  adenylate cyclase  37.38 
 
 
456 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274372  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  35.27 
 
 
505 aa  88.6  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  37.68 
 
 
512 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0322  adenylate cyclase  37.32 
 
 
471 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  35.89 
 
 
492 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5187  adenylate cyclase  37.61 
 
 
455 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670445  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  36.23 
 
 
489 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2542  adenylate cyclase  35.71 
 
 
328 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0798  adenylate cyclase  33.81 
 
 
443 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  36.23 
 
 
489 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5094  adenylate cyclase  37.61 
 
 
455 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  37.2 
 
 
512 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5247  adenylate cyclase  38.53 
 
 
455 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68810  hypothetical protein  37.44 
 
 
454 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  34.45 
 
 
321 aa  84.7  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0276  adenylate cyclase  38.99 
 
 
458 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  35.92 
 
 
596 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  35.71 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0252  adenylate cyclase  37.91 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  33.33 
 
 
445 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  38.76 
 
 
510 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  32.24 
 
 
501 aa  83.2  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>