165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0370 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  100 
 
 
512 aa  979    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  99.02 
 
 
512 aa  968    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  47.29 
 
 
499 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  50.69 
 
 
505 aa  392  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  53.22 
 
 
511 aa  362  7.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  38.09 
 
 
540 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  31.57 
 
 
487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  33.73 
 
 
490 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  34.83 
 
 
508 aa  150  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  33.54 
 
 
505 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  33.6 
 
 
512 aa  141  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  32 
 
 
519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  32.11 
 
 
508 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  31.56 
 
 
596 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  33.33 
 
 
511 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  31.9 
 
 
508 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  31.01 
 
 
513 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  45.54 
 
 
215 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  45.54 
 
 
215 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  33.54 
 
 
494 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  45.54 
 
 
213 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  46.01 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  46.01 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  46.01 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  46.01 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  32.66 
 
 
512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  32.66 
 
 
512 aa  127  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  33.02 
 
 
514 aa  126  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  43.13 
 
 
208 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  45.07 
 
 
213 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  31.93 
 
 
510 aa  124  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  38.1 
 
 
512 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  42.18 
 
 
208 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  41.23 
 
 
211 aa  117  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  36.28 
 
 
433 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  36.28 
 
 
433 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  36.28 
 
 
433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  36.28 
 
 
433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  36.28 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  36.28 
 
 
433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  36.28 
 
 
433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  36.67 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  36.67 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  36.06 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  41.12 
 
 
508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  32.72 
 
 
498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  45.24 
 
 
291 aa  115  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  42.33 
 
 
208 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  42.33 
 
 
208 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  41.12 
 
 
208 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  36.67 
 
 
433 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  35.84 
 
 
433 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  35.84 
 
 
433 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  36.67 
 
 
433 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  44.26 
 
 
207 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  36.19 
 
 
433 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  38.6 
 
 
454 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  35.42 
 
 
511 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0435  adenylate cyclase  42.72 
 
 
208 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  40 
 
 
508 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  41.12 
 
 
208 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0459  adenylate cyclase  41.78 
 
 
208 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.211373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  32.64 
 
 
500 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5954  hypothetical protein  37.07 
 
 
454 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  40 
 
 
508 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  39.52 
 
 
508 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  31.1 
 
 
494 aa  107  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  39.05 
 
 
498 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  40.48 
 
 
286 aa  107  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  33.63 
 
 
539 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  36.12 
 
 
505 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  30.21 
 
 
508 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  38.1 
 
 
435 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  38.28 
 
 
503 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  32.01 
 
 
510 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  38.28 
 
 
503 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  32.54 
 
 
494 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2864  adenylate cyclase  42.99 
 
 
208 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39702  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  35.38 
 
 
529 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  33.57 
 
 
489 aa  103  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  33.96 
 
 
510 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  32.59 
 
 
495 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  37.32 
 
 
503 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  33.57 
 
 
489 aa  103  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  29.83 
 
 
519 aa  103  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  33.92 
 
 
505 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  40.72 
 
 
219 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  34.25 
 
 
495 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  37.96 
 
 
321 aa  101  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  33.33 
 
 
445 aa  101  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  34.93 
 
 
500 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  36.36 
 
 
503 aa  99.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  28.97 
 
 
502 aa  100  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  40.27 
 
 
219 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  36.67 
 
 
433 aa  99.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  33.4 
 
 
509 aa  98.2  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  35.38 
 
 
443 aa  97.8  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3027  adenylate cyclase  43.26 
 
 
206 aa  97.4  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0441666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  33.33 
 
 
443 aa  97.1  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  31.35 
 
 
543 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>