121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0520 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
318 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  34.85 
 
 
596 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  32.95 
 
 
508 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  32.47 
 
 
508 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  32.14 
 
 
508 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  33.09 
 
 
511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  31.8 
 
 
504 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  35.19 
 
 
513 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  34.24 
 
 
510 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  30.58 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  29.97 
 
 
487 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  30.13 
 
 
519 aa  119  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  31.65 
 
 
511 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  31.2 
 
 
512 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  31.2 
 
 
512 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  29.77 
 
 
512 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  31.54 
 
 
329 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  30.25 
 
 
543 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  31.51 
 
 
310 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  31.56 
 
 
510 aa  99  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  31.64 
 
 
505 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  28.4 
 
 
328 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  32.19 
 
 
524 aa  95.5  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  32.35 
 
 
490 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  30.86 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  29.39 
 
 
494 aa  92.8  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  32.04 
 
 
494 aa  92.8  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  29.6 
 
 
558 aa  92.8  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  26.95 
 
 
327 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  28.17 
 
 
920 aa  89.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  30.74 
 
 
540 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  30.74 
 
 
540 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  30.74 
 
 
540 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  30.45 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  27.34 
 
 
313 aa  87  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  30.6 
 
 
555 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  30.43 
 
 
545 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  27.34 
 
 
523 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  28.57 
 
 
545 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  28.17 
 
 
543 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  27.88 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  27.37 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  28.3 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  26.28 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  27.78 
 
 
514 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  26.25 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  29.54 
 
 
588 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  28.41 
 
 
523 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  22.26 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  27.76 
 
 
505 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  29.8 
 
 
721 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.48 
 
 
521 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  28.27 
 
 
495 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  25.79 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  26.51 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  30.35 
 
 
508 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  25.32 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  30.8 
 
 
540 aa  70.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  27.2 
 
 
509 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  31.47 
 
 
520 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  27.24 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  27.49 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  25.59 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  27.89 
 
 
577 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  25.19 
 
 
510 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  28.88 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  27.68 
 
 
344 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  26.64 
 
 
467 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  27.8 
 
 
512 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  30.17 
 
 
492 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  33.8 
 
 
520 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  27.94 
 
 
522 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  26.98 
 
 
527 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  27.6 
 
 
598 aa  63.5  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  28.46 
 
 
496 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  27.98 
 
 
688 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  27.98 
 
 
640 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  27.98 
 
 
640 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  27.98 
 
 
640 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  27.98 
 
 
691 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  27.98 
 
 
649 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  27.98 
 
 
643 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  29.09 
 
 
534 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  26.64 
 
 
492 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  25.28 
 
 
358 aa  59.7  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  27.93 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  27.8 
 
 
304 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  27.86 
 
 
272 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  26.56 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  30.22 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  26.81 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  23.89 
 
 
519 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  27.04 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  22.48 
 
 
505 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  26.72 
 
 
513 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  28.18 
 
 
490 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  28.66 
 
 
544 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  27.13 
 
 
253 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  28.07 
 
 
539 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  27.38 
 
 
719 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>